More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2727 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 307 aa  639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  53.25 
 
 		 311 aa  348  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.31 
 
 		 308 aa  309  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  46.58 
 
 		 325 aa  301  7.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  46.53 
 
 		 311 aa  299  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  48.52 
 
 		 306 aa  298  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  48.21 
 
 		 315 aa  298  9e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  46.84 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  42.26 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.94 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.35 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1449  GTPase YjeQ  35.74 
 
 		 315 aa  185  9e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.01 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  37.09 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.1 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  33.55 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  36.33 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  36.16 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  34.8 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.42 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.96 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  38.54 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.42 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.31 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  34.31 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.45 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  33.99 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.77 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.22 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.84 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.42 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.5 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  38.04 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.99 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 290 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  34.32 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  32.46 
 
 		 350 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  32.46 
 
 		 350 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  32.46 
 
 		 350 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.74 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  32.9 
 
 		 349 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  31.72 
 
 		 353 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  39.35 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  39.35 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  39.35 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  39.35 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  33 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.59 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  32.34 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  34.15 
 
 		 351 aa  168  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  40.09 
 
 		 347 aa  168  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  40.19 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.91 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  34.32 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2576  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  35.47 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  33.77 
 
 		 290 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.67 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36.69 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 372 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  33.08 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  35.34 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  33.47 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  34.33 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  33.89 
 
 		 343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0905  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569285  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  33.86 
 
 		 354 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0347  ribosome-associated GTPase  39.09 
 
 		 358 aa  162  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0044619  unclonable  0.00000256254 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3754  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 		 349 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.99 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  34.22 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.89 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  33.11 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  36.94 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  38.99 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.76 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3932  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  30.1 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>