More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1346 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1346  GTPase EngC  100 
 
 		 312 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.497247  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00181  GTPases  98.4 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.712591  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00191  GTPase  49.68 
 
 		 313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.0640635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00231  GTPase  49.84 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0022  GTPase EngC  49.01 
 
 		 300 aa  292  4e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0026  GTPase EngC  47.44 
 
 		 304 aa  285  8e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  45.95 
 
 		 380 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  44.9 
 
 		 376 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  44.56 
 
 		 405 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  44.59 
 
 		 374 aa  251  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  43.39 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.95 
 
 		 370 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  41.69 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  39.35 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00181  GTPase  38.24 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00181  GTPases  39.77 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.655275  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00181  GTPase  38.78 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0019  GTPase EngC  36.99 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  37.92 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.27 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.57 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  39.13 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.91 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  37.45 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  37.45 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.3 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  38.02 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  39.13 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  39.13 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  39.13 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  39.13 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  39.13 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  39.13 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  39.13 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  37.94 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.69 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.31 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  37.69 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  37.99 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.45 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.68 
 
 		 302 aa  146  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.34 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.1 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.77 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.89 
 
 		 290 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.06 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.54 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.27 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.89 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.65 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  33.57 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.16 
 
 		 291 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  32.74 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  34.98 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.37 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.65 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  33.11 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  33.73 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  34.84 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  30.16 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  36.65 
 
 		 354 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36.73 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  33.59 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.7 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.24 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  34.26 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  36.2 
 
 		 352 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.91 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  35.25 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  35.25 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.46 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.91 
 
 		 354 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  32.32 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 		 290 aa  123  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0983  GTPase EngC  32.31 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  30.65 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.78 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 		 354 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1449  GTPase YjeQ  32.78 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.9 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.62 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.03 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.03 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.03 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  31.76 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.03 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  30.91 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.493781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  34.84 
 
 		 352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.29 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  34.67 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  34.05 
 
 		 354 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.92 
 
 		 360 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  28.88 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  29.64 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  28.57 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>