More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1820 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 364 aa  719    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  62.86 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  56.37 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  50.98 
 
 		 357 aa  292  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  47.7 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  41 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.94 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.91 
 
 		 367 aa  256  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.04 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  40.57 
 
 		 351 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.07 
 
 		 359 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  47.71 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  51.48 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  44.68 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  46.76 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.49 
 
 		 358 aa  239  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  36.71 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.96 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  49.32 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  36.42 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  36.71 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 349 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 364 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  35.84 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.53 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  35.84 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  41.76 
 
 		 356 aa  229  8e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.22 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.38 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  38.38 
 
 		 369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  39.48 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  41.57 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  41.52 
 
 		 348 aa  222  8e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.19 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  39.44 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  40.45 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.96 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.01 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  43.52 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  37.61 
 
 		 364 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  40.11 
 
 		 350 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.34 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.06 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  40.62 
 
 		 354 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.61 
 
 		 363 aa  202  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  39.46 
 
 		 396 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  40.92 
 
 		 340 aa  202  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.61 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  45.42 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  35.31 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  41.36 
 
 		 350 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.91 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.07 
 
 		 354 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.24 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.4 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  39.29 
 
 		 344 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  38.99 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  33.82 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.74 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  38.7 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  32.07 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  40.46 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  36.31 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  38.49 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  37.04 
 
 		 356 aa  179  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  36.22 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  40.38 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  36.49 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.64 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  42.26 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  35.26 
 
 		 347 aa  173  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  39.29 
 
 		 346 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  32.86 
 
 		 353 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.95 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.82 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.19 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  37.88 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  33.75 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  43.46 
 
 		 348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3112  GTPase EngC  45 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  36.71 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  40.62 
 
 		 346 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  38.11 
 
 		 355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.93 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  33.46 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  41 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  37.21 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.31 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.88 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  37.41 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.4 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.06 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.88 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.77 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>