More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2240 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  100 
 
 		 356 aa  733    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  79.6 
 
 		 353 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  79.37 
 
 		 352 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  61.85 
 
 		 351 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.45 
 
 		 360 aa  427  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  54.5 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  50 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.43 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.71 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.86 
 
 		 355 aa  344  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  48.56 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.47 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  38.92 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  43.45 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.75 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  41.26 
 
 		 358 aa  235  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  37.6 
 
 		 365 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.12 
 
 		 358 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  39.01 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.71 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  38.7 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  38.7 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  38.7 
 
 		 364 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  38.7 
 
 		 364 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  38.7 
 
 		 364 aa  225  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.76 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  40.85 
 
 		 358 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  37.15 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  35.9 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  38.7 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  38.39 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  37.99 
 
 		 349 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.06 
 
 		 355 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  37.28 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.12 
 
 		 359 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.24 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  35.26 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.94 
 
 		 363 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  35.04 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  35.34 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  35.77 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.75 
 
 		 343 aa  199  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.09 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.84 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  34.48 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 396 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.3 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.04 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  35.99 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  42.23 
 
 		 346 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  33.42 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  34.03 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  36.46 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  42.31 
 
 		 363 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  37.84 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  38.25 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.88 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  36.2 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  36.34 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  34.23 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  43.19 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  38.6 
 
 		 332 aa  173  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.92 
 
 		 386 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.97 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  38.48 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  33.22 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  34.98 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  35.25 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  34.65 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  35.69 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  35.76 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  34.24 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  34.24 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.37 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  35.54 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.94 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  33.7 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  34.91 
 
 		 355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.01 
 
 		 394 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  30.63 
 
 		 394 aa  155  9e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  35.47 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.77 
 
 		 350 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.65 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.75 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  37.55 
 
 		 346 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.96 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1488  GTPase EngC  28.98 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00498861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  35.17 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  33.23 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.08 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 315 aa  133  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  37.69 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  34.63 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  33.08 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  32.62 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1285  GTPase EngC  46.71 
 
 		 204 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0396648  normal  0.396144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>