More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1488 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1488  GTPase EngC  100 
 
 		 325 aa  669    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00498861 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  43.66 
 
 		 358 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  41.54 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  38.6 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  38.01 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  38.05 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  38.26 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  35.83 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  34.53 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  35.03 
 
 		 346 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.71 
 
 		 367 aa  178  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  37.25 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  34.08 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  35.51 
 
 		 354 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.55 
 
 		 359 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  35.92 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  33.65 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  32.31 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.84 
 
 		 358 aa  165  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  33.02 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.23 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  32.71 
 
 		 344 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  32.5 
 
 		 349 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  33.65 
 
 		 364 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.35 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  32.19 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  32.19 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  32.19 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  31.87 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  33.88 
 
 		 332 aa  158  9e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  31.56 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  31.87 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  31.46 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  33.33 
 
 		 347 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  31.75 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.19 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  32.1 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  31.33 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  34.23 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  30.29 
 
 		 382 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  31.63 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  28.97 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.09 
 
 		 355 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.91 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  29.36 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  31.76 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  28.12 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  30.13 
 
 		 361 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.86 
 
 		 354 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.63 
 
 		 364 aa  132  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.46 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  26.93 
 
 		 371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  28.17 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  31.33 
 
 		 350 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.34 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  27.83 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  32.39 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  31.31 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  26.82 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  26.26 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  26.44 
 
 		 358 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.87 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.56 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.5 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  28.48 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.07 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  34.74 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  27.86 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.58 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  34.11 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  30.46 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  26.59 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.03 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  29.24 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  30 
 
 		 341 aa  102  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  27.76 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  31.67 
 
 		 387 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  26.4 
 
 		 356 aa  99.4  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  28.67 
 
 		 355 aa  99  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  35.82 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  29.41 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1285  GTPase EngC  37.09 
 
 		 204 aa  96.7  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0396648  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  28.57 
 
 		 372 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  29.95 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.8 
 
 		 394 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.76 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  27.59 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  29.37 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.18 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  29.44 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  27.62 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  25.41 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  30.23 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  30.23 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.17 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  24.68 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  25.33 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>