More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1746 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  97.89 
 
 
332 aa  644    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  100 
 
 
332 aa  672    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  66.06 
 
 
363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  69.52 
 
 
369 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  47.63 
 
 
358 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  47.3 
 
 
358 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  42.11 
 
 
351 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.56 
 
 
333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  47.62 
 
 
344 aa  241  9e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  42.73 
 
 
365 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  43.65 
 
 
395 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.18 
 
 
367 aa  236  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  47.08 
 
 
396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.63 
 
 
358 aa  232  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45 
 
 
359 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  41.89 
 
 
347 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  45.39 
 
 
354 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  46.48 
 
 
349 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  46.48 
 
 
349 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  46.48 
 
 
364 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  46.48 
 
 
364 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  46.48 
 
 
364 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  46.09 
 
 
349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.45 
 
 
355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  46.48 
 
 
364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  46.88 
 
 
349 aa  225  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  46.09 
 
 
349 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  45.31 
 
 
349 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.09 
 
 
367 aa  222  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.59 
 
 
359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  46.51 
 
 
351 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  42.81 
 
 
358 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  41.9 
 
 
358 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  41.4 
 
 
364 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  44.57 
 
 
369 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  47.15 
 
 
356 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  42.41 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  42.12 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  41.34 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.47 
 
 
343 aa  198  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  44.36 
 
 
350 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.18 
 
 
340 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  47.42 
 
 
346 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  40.52 
 
 
373 aa  195  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  43.84 
 
 
348 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  41.23 
 
 
351 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  47.39 
 
 
361 aa  192  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  45.56 
 
 
346 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  39.82 
 
 
357 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  39.78 
 
 
371 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  43.13 
 
 
341 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.43 
 
 
350 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.4 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  44.76 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.64 
 
 
360 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.01 
 
 
386 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.66 
 
 
349 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  45.25 
 
 
360 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  42.86 
 
 
350 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.13 
 
 
364 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.43 
 
 
350 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.35 
 
 
354 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.38 
 
 
364 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  38.63 
 
 
350 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  43.23 
 
 
344 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.29 
 
 
358 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.75 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.38 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  44.91 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.89 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  36.59 
 
 
382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  42.96 
 
 
348 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.96 
 
 
355 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.33 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  40.47 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  38.61 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.23 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.38 
 
 
333 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  37.46 
 
 
356 aa  162  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  38.3 
 
 
356 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1488  GTPase EngC  33.88 
 
 
325 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00498861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  40.86 
 
 
372 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  39.53 
 
 
387 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  41.02 
 
 
344 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  34.3 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1285  GTPase EngC  50 
 
 
204 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0396648  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  35.82 
 
 
394 aa  143  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.74 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  35.11 
 
 
355 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  37.8 
 
 
340 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  32.82 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  32.71 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.17 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.46 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  35.32 
 
 
343 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.76 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  35.32 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  35.32 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 
289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.67 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>