More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1011 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 396 aa  809    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  64.65 
 
 		 395 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  59.71 
 
 		 358 aa  428  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  60.3 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  57.75 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  53.08 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  48.66 
 
 		 354 aa  309  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.4 
 
 		 367 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  43.79 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  43.87 
 
 		 365 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  43.79 
 
 		 364 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  43.79 
 
 		 364 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  43.79 
 
 		 364 aa  272  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  43.34 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  43.48 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  43.48 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  43.48 
 
 		 349 aa  269  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  42.86 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  42.24 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  42.45 
 
 		 347 aa  262  6.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.26 
 
 		 359 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.37 
 
 		 358 aa  256  7e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  43.21 
 
 		 344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  41.12 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  42.59 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  38.9 
 
 		 351 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  43.53 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.33 
 
 		 359 aa  249  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1488  GTPase EngC  38.6 
 
 		 325 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00498861 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  40.54 
 
 		 350 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  36.73 
 
 		 382 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  41.95 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  43.52 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  42.59 
 
 		 346 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  47.08 
 
 		 332 aa  236  7e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.42 
 
 		 367 aa  235  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  39.22 
 
 		 369 aa  235  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.15 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.28 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  47.42 
 
 		 332 aa  232  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.97 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  38.73 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.85 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  38.75 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  41.89 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.19 
 
 		 354 aa  213  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  39.56 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.57 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.29 
 
 		 355 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.22 
 
 		 358 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.46 
 
 		 364 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.32 
 
 		 341 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  38.92 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  41.02 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  37.54 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.4 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38 
 
 		 355 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  37.25 
 
 		 359 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  44.86 
 
 		 361 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.29 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  36.14 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  36.62 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.13 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  34.97 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  34.25 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  35.84 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  40.4 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.92 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  35.63 
 
 		 356 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  36.39 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.54 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.6 
 
 		 333 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.87 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  38.57 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  38.3 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  35.36 
 
 		 356 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.7 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.66 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  37.41 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  39.19 
 
 		 348 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  36.87 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.08 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  34.54 
 
 		 364 aa  163  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  33.63 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  39.29 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  34.22 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1285  GTPase EngC  42.22 
 
 		 204 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0396648  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  34.66 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  32.51 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  36.41 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  32.76 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  34.7 
 
 		 337 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  31.8 
 
 		 343 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  35.8 
 
 		 354 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  31.8 
 
 		 343 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  31.43 
 
 		 343 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  35.8 
 
 		 354 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.04 
 
 		 352 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.04 
 
 		 351 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>