More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2800 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  100 
 
 
356 aa  735    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  67.05 
 
 
355 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  67.05 
 
 
355 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.91 
 
 
360 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  61.41 
 
 
358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  50 
 
 
356 aa  359  4e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  51.43 
 
 
353 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  50.15 
 
 
352 aa  348  8e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  49.71 
 
 
351 aa  338  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  47.55 
 
 
371 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  46.7 
 
 
348 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  39.43 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  39.69 
 
 
356 aa  230  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  37.18 
 
 
351 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  36.24 
 
 
349 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  35.34 
 
 
365 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  35.49 
 
 
349 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  35.49 
 
 
349 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  36.66 
 
 
373 aa  226  7e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  40.43 
 
 
358 aa  225  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  35.21 
 
 
364 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  35.21 
 
 
364 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  35.21 
 
 
364 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  35.21 
 
 
364 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.4 
 
 
354 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.47 
 
 
367 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  34.93 
 
 
349 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  35.21 
 
 
349 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  38.79 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.06 
 
 
359 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  37.54 
 
 
358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.7 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  35.21 
 
 
349 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  40.06 
 
 
358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.23 
 
 
362 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 
395 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.87 
 
 
355 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  36.31 
 
 
347 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.55 
 
 
333 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.45 
 
 
359 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  37.25 
 
 
354 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.72 
 
 
358 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.67 
 
 
343 aa  205  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  39.45 
 
 
369 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  36.24 
 
 
364 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  35.63 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.7 
 
 
364 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  39.22 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.38 
 
 
341 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  35.98 
 
 
382 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  36.52 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  36.89 
 
 
351 aa  196  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  36.57 
 
 
363 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  45.68 
 
 
361 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.36 
 
 
386 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.12 
 
 
340 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.99 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  36.65 
 
 
369 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  36.06 
 
 
344 aa  189  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  38.7 
 
 
360 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  41.09 
 
 
352 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.62 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  36.84 
 
 
341 aa  182  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  34.55 
 
 
372 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  39.38 
 
 
350 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  35.82 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  35.47 
 
 
394 aa  176  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  37.58 
 
 
332 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40 
 
 
350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  37.46 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.8 
 
 
349 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.25 
 
 
333 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  35.78 
 
 
350 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  37.8 
 
 
346 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  37.92 
 
 
344 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  34.82 
 
 
350 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.26 
 
 
394 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  39.36 
 
 
346 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  38.75 
 
 
387 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  37.92 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  36.84 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  31.13 
 
 
364 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  33.22 
 
 
355 aa  152  8.999999999999999e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  39.36 
 
 
352 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3112  GTPase EngC  35.45 
 
 
261 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  36.84 
 
 
354 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  36.84 
 
 
354 aa  136  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.94 
 
 
324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  36.84 
 
 
354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  37.86 
 
 
354 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.5 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  37.5 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  31.91 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>