More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2785 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 355 aa  728    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  91.27 
 
 		 355 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  67.05 
 
 		 356 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  64.04 
 
 		 358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.54 
 
 		 360 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  48.86 
 
 		 356 aa  347  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  49.86 
 
 		 353 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  49.71 
 
 		 352 aa  338  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  47.4 
 
 		 351 aa  325  6e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  45.23 
 
 		 371 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  43.35 
 
 		 348 aa  301  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  38.86 
 
 		 349 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  38.86 
 
 		 349 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  38.96 
 
 		 364 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  38.96 
 
 		 364 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  38.96 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  38.96 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  38.89 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  38.55 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  38.25 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.09 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  39.2 
 
 		 349 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.89 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  39.11 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  35.79 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.18 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  36.72 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  41.49 
 
 		 358 aa  225  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  38.17 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  38.07 
 
 		 395 aa  225  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  42.14 
 
 		 358 aa  222  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  35.9 
 
 		 356 aa  222  9e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.28 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.9 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  38.57 
 
 		 358 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.6 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  37.39 
 
 		 358 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.98 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.27 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  38 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  43.06 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.46 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  37.14 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.6 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  35.53 
 
 		 351 aa  202  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  34.38 
 
 		 347 aa  199  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  40.49 
 
 		 369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.94 
 
 		 364 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  37.31 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  39.38 
 
 		 350 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  39.29 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.77 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  36.41 
 
 		 364 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  42.97 
 
 		 363 aa  189  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.43 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.62 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  41.33 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  40.74 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.31 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  38.7 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  38.7 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  37.19 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.94 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  39.45 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  33.73 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  39.59 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  38.62 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.02 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  32.98 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  37.14 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  33.7 
 
 		 372 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.51 
 
 		 349 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  37.99 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  36.94 
 
 		 357 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.68 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.16 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  36.36 
 
 		 344 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  35.91 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  31.76 
 
 		 364 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  35.73 
 
 		 344 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35.74 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  36.4 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  32.67 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  37.92 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  37.92 
 
 		 354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  37.92 
 
 		 354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  37.92 
 
 		 354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  38.68 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36.15 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>