More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04839 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 358 aa  744    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  76.82 
 
 		 358 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  61.47 
 
 		 395 aa  431  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  59.71 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  57.48 
 
 		 347 aa  424  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  55.26 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  51.86 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.38 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  44.31 
 
 		 351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  47.81 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1488  GTPase EngC  43.66 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00498861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  46.59 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  43.66 
 
 		 365 aa  278  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  46.58 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  46.27 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  41.45 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  41.45 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  44.28 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  41.45 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  41.45 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  41.45 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  45.1 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  41.16 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  41.16 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  43.17 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  41.09 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.62 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  40.87 
 
 		 349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.3 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  44.21 
 
 		 350 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  41.45 
 
 		 349 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.06 
 
 		 359 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  47.63 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  49.66 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.17 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.05 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.77 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  43.47 
 
 		 346 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.32 
 
 		 333 aa  245  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  40.22 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  40.5 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  38.4 
 
 		 351 aa  229  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  42.9 
 
 		 358 aa  228  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.24 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  39.56 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.87 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.38 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  38.97 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.48 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.96 
 
 		 358 aa  222  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  38.72 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  37.57 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.25 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  36.39 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.58 
 
 		 350 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.17 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  40.3 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.35 
 
 		 341 aa  212  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  37.54 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.82 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  34.19 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.84 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  36.42 
 
 		 357 aa  206  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  35.33 
 
 		 364 aa  205  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  40.66 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  39.5 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.68 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.39 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  34.3 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  40 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.74 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  35.06 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  35.06 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  37.28 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.67 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.55 
 
 		 362 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  37.72 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.02 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  36.69 
 
 		 344 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.66 
 
 		 394 aa  182  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  38.06 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  40.15 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  35.65 
 
 		 364 aa  179  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  37.54 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  32.74 
 
 		 387 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  34.47 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1285  GTPase EngC  42.47 
 
 		 204 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0396648  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  32.82 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  36.07 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  36.07 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  36.07 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.8 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  32.65 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  33.58 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  35.53 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  32.04 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  34.19 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36 
 
 		 351 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  33.56 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>