More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0794 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  100 
 
 		 358 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  65.74 
 
 		 358 aa  428  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  44.67 
 
 		 349 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  44.67 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  44.67 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  44.67 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  44.67 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  44.09 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  44.09 
 
 		 349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  43.8 
 
 		 349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  43.52 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  44.19 
 
 		 365 aa  299  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  41.6 
 
 		 349 aa  295  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  45.06 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.94 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  45.74 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.78 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.95 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.38 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.73 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.73 
 
 		 360 aa  271  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.51 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  43.32 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  44.92 
 
 		 353 aa  265  7e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  44.15 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  43.63 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  42.17 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.55 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.8 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  41.47 
 
 		 358 aa  249  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.67 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  45.15 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  39.83 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  39.77 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  41.46 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  37.07 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.06 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.34 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.29 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  38.99 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.74 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  37.99 
 
 		 354 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.11 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.91 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.33 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  43.82 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  39.5 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.85 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  45.57 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  44.79 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  40.85 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.35 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.79 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  46.43 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  43.15 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  40.93 
 
 		 369 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  45.78 
 
 		 361 aa  222  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.15 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  41.24 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  46.08 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.19 
 
 		 386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  42.86 
 
 		 344 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  44.07 
 
 		 346 aa  215  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  42.86 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  37.03 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  34.76 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  41.28 
 
 		 360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.59 
 
 		 333 aa  212  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.68 
 
 		 362 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  42.31 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  46.8 
 
 		 346 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.9 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  39.08 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  40.77 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  43.02 
 
 		 350 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  43.3 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  41.61 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  39.38 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  34.22 
 
 		 364 aa  196  7e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  39.53 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  41.52 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  45.76 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  42.21 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.36 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.91 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  37.86 
 
 		 387 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  37.32 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  39.57 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1488  GTPase EngC  31.2 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00498861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  31.65 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36.92 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  37.02 
 
 		 354 aa  159  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  36.55 
 
 		 347 aa  159  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  37.29 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.51 
 
 		 319 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>