More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4068 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  100 
 
 		 387 aa  761    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  47.74 
 
 		 372 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.71 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  52.16 
 
 		 352 aa  247  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  44.29 
 
 		 360 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  48.21 
 
 		 341 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  39.32 
 
 		 351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  44.41 
 
 		 357 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  35.46 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.19 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  37.41 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  38.11 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  37.76 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  37.76 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  37.76 
 
 		 364 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  37.76 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  37.76 
 
 		 364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  37.41 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.73 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.18 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  37.41 
 
 		 349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.23 
 
 		 364 aa  213  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40 
 
 		 359 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  38.33 
 
 		 349 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  47.62 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  44.53 
 
 		 356 aa  212  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.46 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40 
 
 		 367 aa  210  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.05 
 
 		 358 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  42.34 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  40.11 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  34.8 
 
 		 369 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.36 
 
 		 324 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.97 
 
 		 355 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.45 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.66 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  42.54 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  41.36 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.77 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  43.71 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  39.78 
 
 		 350 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.43 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  41.14 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.52 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  35.65 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.29 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  35.18 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  38.28 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.86 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.64 
 
 		 349 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  34.22 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  32.77 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  39.02 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  32.05 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  36.09 
 
 		 347 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.99 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.64 
 
 		 333 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.99 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.2 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.31 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  37.95 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  34.65 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  37.16 
 
 		 351 aa  172  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  37.5 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  39.47 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  38.58 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  38.15 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  39.25 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.21 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  32.62 
 
 		 353 aa  166  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  36.1 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  37.16 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  33.33 
 
 		 352 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  36.86 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  35.96 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  29.6 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  34.53 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  36.57 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  41.6 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  42.86 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.5 
 
 		 341 aa  156  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  35.59 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  37.76 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  42.79 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  31.32 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1285  GTPase EngC  36.79 
 
 		 204 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0396648  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3112  GTPase EngC  42.21 
 
 		 261 aa  133  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  34.48 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  32.27 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  34.69 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.73 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  34.22 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  33.46 
 
 		 352 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1568  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.25 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.98 
 
 		 294 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1850  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.62 
 
 		 294 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.055373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  34.22 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.61 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>