More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00740 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  100 
 
 
355 aa  714    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.69 
 
 
324 aa  329  4e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.11 
 
 
333 aa  329  6e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  42.95 
 
 
358 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  39.55 
 
 
349 aa  202  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  40.61 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  39.18 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  39.55 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  39.55 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  39.55 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  39.55 
 
 
364 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  39.55 
 
 
349 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  39.25 
 
 
349 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.3 
 
 
386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  43.8 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  38.7 
 
 
349 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.22 
 
 
367 aa  195  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.57 
 
 
355 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.54 
 
 
362 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.05 
 
 
343 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  39.09 
 
 
360 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.09 
 
 
359 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  41.11 
 
 
341 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.67 
 
 
359 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  42.31 
 
 
344 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  38.06 
 
 
369 aa  186  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  36.17 
 
 
394 aa  186  8e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  38.26 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  36.4 
 
 
373 aa  182  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.56 
 
 
340 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.69 
 
 
358 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  41.29 
 
 
357 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  42.25 
 
 
356 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  35.91 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.15 
 
 
394 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.23 
 
 
364 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.76 
 
 
341 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.87 
 
 
358 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  36.39 
 
 
364 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  41.12 
 
 
350 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  34.22 
 
 
396 aa  166  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  39.13 
 
 
348 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.94 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.12 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  35.14 
 
 
371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.95 
 
 
364 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  33.94 
 
 
395 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.42 
 
 
333 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  41.94 
 
 
352 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  34.31 
 
 
358 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  38.93 
 
 
363 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.64 
 
 
355 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  33.44 
 
 
351 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  37.3 
 
 
359 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.63 
 
 
367 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32 
 
 
360 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  34.77 
 
 
348 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.02 
 
 
355 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  35.92 
 
 
369 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.45 
 
 
350 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  33.66 
 
 
351 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  33.08 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  33.46 
 
 
358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  39.37 
 
 
361 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  35.92 
 
 
350 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  32.71 
 
 
364 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  34.65 
 
 
356 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  37.67 
 
 
340 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.52 
 
 
349 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  34.04 
 
 
352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  37.27 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  32.96 
 
 
351 aa  146  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  33.96 
 
 
352 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  34.8 
 
 
356 aa  146  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  36.26 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  32.12 
 
 
353 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  30.63 
 
 
347 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  28.62 
 
 
382 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  32.88 
 
 
337 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  37.76 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  32.52 
 
 
352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  36.64 
 
 
344 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  35.25 
 
 
347 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  35.74 
 
 
350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  38.43 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  36.64 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  32.71 
 
 
354 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  30.93 
 
 
350 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.22 
 
 
354 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  36.74 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  32.64 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  32.75 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  32.75 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  32.34 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  35.66 
 
 
299 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  32.76 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  33.89 
 
 
353 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>