More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  100 
 
 		 344 aa  670    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  57.53 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  57.14 
 
 		 352 aa  275  8e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.76 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.36 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  39.72 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.42 
 
 		 340 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.32 
 
 		 386 aa  242  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  39.19 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  46.83 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  44.67 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.3 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  44.54 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  45.17 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  35.88 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.9 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  44.38 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.91 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.7 
 
 		 358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  35.31 
 
 		 349 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  43.67 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 		 364 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  35.53 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.6 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  35.31 
 
 		 349 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  35.31 
 
 		 349 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  35.31 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  45.53 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  38.78 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.97 
 
 		 367 aa  209  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  36.02 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  48.71 
 
 		 344 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.95 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.3 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.61 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.43 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  41.36 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.31 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  39.18 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  37.93 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  36.69 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  40.91 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.57 
 
 		 394 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  36.06 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  40.27 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.09 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  38.3 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  43.59 
 
 		 350 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.52 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  37.36 
 
 		 373 aa  192  9e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.44 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  41.26 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.82 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  37.94 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  43.23 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  45.82 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  35.69 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  44.66 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  34.87 
 
 		 347 aa  182  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  42.48 
 
 		 332 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.22 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  38.44 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  37.01 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  47.08 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.71 
 
 		 354 aa  175  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  46.9 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30 
 
 		 363 aa  172  9e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  33.33 
 
 		 382 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.51 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  36.63 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  38.06 
 
 		 352 aa  165  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  36.79 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  35.99 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.06 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.36 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3112  GTPase EngC  44.98 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  39.09 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  37.89 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  35.69 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  36.45 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  36.45 
 
 		 344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  33.13 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  32.22 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  35.48 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  38.13 
 
 		 313 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.46 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  38.36 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  38.13 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.63 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  38.13 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  38.01 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  38.01 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  39.92 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  39.92 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  37.29 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>