More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1431 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 355 aa  731    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  91.27 
 
 		 355 aa  643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  67.05 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  65.91 
 
 		 358 aa  485  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.26 
 
 		 360 aa  454  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  51.71 
 
 		 356 aa  358  8e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  52.71 
 
 		 353 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  51.44 
 
 		 352 aa  346  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  48.13 
 
 		 351 aa  323  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  45.5 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  42.82 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.99 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  38.27 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  40.57 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  38.27 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  38.27 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.69 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  38.27 
 
 		 349 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  38.58 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  37.96 
 
 		 349 aa  238  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.91 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  38.2 
 
 		 344 aa  232  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  36.07 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  39.11 
 
 		 373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  40.99 
 
 		 358 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  42.77 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  37.57 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.39 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  38.86 
 
 		 358 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  38 
 
 		 354 aa  219  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  38.29 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  38 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  35.43 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.97 
 
 		 355 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  37.68 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  43.25 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.76 
 
 		 362 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.2 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.61 
 
 		 367 aa  209  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.43 
 
 		 341 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.6 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  33.62 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.12 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  41.23 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  35.88 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  40.84 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  39.32 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.34 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.8 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  43.73 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  37.61 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.96 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  35.51 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.62 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  40.96 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  40.37 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.36 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  37.35 
 
 		 350 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  37.27 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  39.29 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  40.23 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  33.6 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  39.22 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  37.77 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.07 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  38.04 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  37.42 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.06 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  36.04 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.88 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  33.43 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  35.41 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.85 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  37.06 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  37.99 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  33.33 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  36.68 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  36.57 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.87 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  33.71 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  35.13 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.25 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.77 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  35 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  35.36 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 350 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  37.45 
 
 		 353 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>