More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0551 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 
363 aa  737    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.69 
 
 
333 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.3 
 
 
358 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  34.52 
 
 
351 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  33.6 
 
 
364 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  34.45 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  32.69 
 
 
365 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  35.15 
 
 
364 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.92 
 
 
367 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  34.85 
 
 
364 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  34.85 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  34.85 
 
 
364 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  32.1 
 
 
358 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  33.98 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  34.85 
 
 
349 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  33.98 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  33.85 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.34 
 
 
355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.06 
 
 
359 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  33.64 
 
 
349 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  32.72 
 
 
358 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.54 
 
 
359 aa  208  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.53 
 
 
343 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  31.13 
 
 
373 aa  207  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.79 
 
 
367 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.61 
 
 
364 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.27 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  33.43 
 
 
353 aa  196  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.21 
 
 
360 aa  195  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  31.79 
 
 
356 aa  194  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  32.65 
 
 
356 aa  192  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  31.28 
 
 
351 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  31.36 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  31.78 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  33.06 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  30.77 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  33.54 
 
 
361 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  33.67 
 
 
358 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.5 
 
 
354 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  32.48 
 
 
358 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  31.21 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  28.4 
 
 
357 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.3 
 
 
362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.44 
 
 
364 aa  179  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.08 
 
 
349 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  32.85 
 
 
364 aa  179  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  28.23 
 
 
371 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  30.66 
 
 
396 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.84 
 
 
333 aa  176  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.84 
 
 
341 aa  176  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  30.99 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 
332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  29.41 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  30.39 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 
363 aa  172  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  35.66 
 
 
369 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  29.97 
 
 
347 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  28.12 
 
 
360 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  27.76 
 
 
348 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  34.84 
 
 
369 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.94 
 
 
355 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.92 
 
 
386 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.07 
 
 
355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  28.36 
 
 
394 aa  165  9e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  28.28 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  27.99 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  30 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  28.66 
 
 
344 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  31.27 
 
 
359 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 
306 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  29.09 
 
 
350 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  30.62 
 
 
355 aa  159  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.39 
 
 
350 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.16 
 
 
350 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.28 
 
 
340 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  32.14 
 
 
352 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.92 
 
 
324 aa  158  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  27.78 
 
 
350 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  30.42 
 
 
350 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  30.62 
 
 
348 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  29.31 
 
 
347 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.68 
 
 
302 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 
337 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  29.11 
 
 
387 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  32.94 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  34.44 
 
 
347 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  27.49 
 
 
346 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  30.52 
 
 
341 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  34.43 
 
 
351 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.45 
 
 
394 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.69 
 
 
319 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.54 
 
 
293 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.39 
 
 
319 aa  143  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.83 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.46 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  32.27 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  31.42 
 
 
289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 
325 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 
352 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>