More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2727 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  100 
 
 		 364 aa  731    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  37.27 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  35.61 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  36.44 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  35.61 
 
 		 364 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  35.61 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  35.61 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  35.61 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  36.65 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  36.15 
 
 		 349 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  38.42 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  35.09 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.71 
 
 		 367 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  33.95 
 
 		 358 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.37 
 
 		 333 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.28 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.13 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  34.95 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.91 
 
 		 355 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.58 
 
 		 358 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.28 
 
 		 359 aa  185  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  34.16 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.31 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  35.65 
 
 		 358 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  37.81 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.85 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  35.33 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.52 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.77 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  36.39 
 
 		 358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  32.27 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  35.42 
 
 		 351 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  29.97 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.77 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.27 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  36.92 
 
 		 347 aa  169  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  35.94 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  31.27 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  36.64 
 
 		 352 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  35.89 
 
 		 356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  37.28 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  32.09 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  33.45 
 
 		 363 aa  162  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.46 
 
 		 354 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  35.07 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.03 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  32.41 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  33.43 
 
 		 350 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  35.53 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.66 
 
 		 364 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.72 
 
 		 362 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  37.54 
 
 		 354 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.1 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  35.97 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  30.36 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.42 
 
 		 364 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  40.37 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  34.53 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  37.83 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.76 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  31.74 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  32.71 
 
 		 355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  37.83 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  29.24 
 
 		 357 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  35.19 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.1 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.22 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.68 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  30.61 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  30.36 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  27.3 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  32.29 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  33.03 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  32.63 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  31.29 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1488  GTPase EngC  31.76 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00498861 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  34.02 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  27.61 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  31.49 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.33 
 
 		 316 aa  133  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  30.07 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  28.09 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  32.96 
 
 		 360 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  34.08 
 
 		 290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  33.68 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  28.32 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.56 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.33 
 
 		 319 aa  126  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  32.17 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.93 
 
 		 306 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  31.92 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  33.07 
 
 		 344 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.91 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  32.21 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>