More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6175 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  100 
 
 		 344 aa  656    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.37 
 
 		 364 aa  335  9e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  52.57 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  51.13 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  48.75 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  52.29 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.94 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.96 
 
 		 362 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  37.22 
 
 		 364 aa  245  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  37.22 
 
 		 364 aa  245  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  37.22 
 
 		 349 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  37.22 
 
 		 364 aa  245  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  37.68 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  36.93 
 
 		 349 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  36.65 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  47.06 
 
 		 358 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  36.41 
 
 		 365 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  40.23 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  35.92 
 
 		 349 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.61 
 
 		 367 aa  231  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  37.36 
 
 		 369 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  45.14 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.44 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  50.14 
 
 		 344 aa  228  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.18 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  40.79 
 
 		 351 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.77 
 
 		 364 aa  222  9e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  39.24 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.12 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.1 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.27 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  47.92 
 
 		 341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  46.39 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  36.76 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  40.17 
 
 		 340 aa  209  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  36.31 
 
 		 347 aa  208  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  45.05 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.87 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.87 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.53 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  38.08 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.19 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.72 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  34.62 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  42.54 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.98 
 
 		 359 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 396 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.86 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.07 
 
 		 333 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  38.75 
 
 		 347 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  45.08 
 
 		 358 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.58 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  48.8 
 
 		 350 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.15 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  36.29 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  43.35 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  45.42 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.24 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  47.44 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  39 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  42.72 
 
 		 344 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  37.92 
 
 		 356 aa  188  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.09 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  38.56 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  46.8 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  37.78 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.13 
 
 		 341 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  34.11 
 
 		 382 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.57 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  36.41 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  38.46 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.44 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.73 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  176  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  37.65 
 
 		 351 aa  175  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  35.71 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  36.26 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  39.09 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  41.14 
 
 		 332 aa  173  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3112  GTPase EngC  50.19 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  41.36 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  37.93 
 
 		 351 aa  169  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  49.04 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  41.24 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  29.38 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  37.2 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  35.69 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  36.54 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  37.04 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.63 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.63 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  37.39 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.25 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  32.67 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  37.84 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  37.55 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 351 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  35.54 
 
 		 354 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>