More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1503 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 334 aa  670    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  40.25 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  47.81 
 
 		 289 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  40 
 
 		 340 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  39.04 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  41.92 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  44.14 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  41.92 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  41.58 
 
 		 343 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.14 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  39.04 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  41.58 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  41.24 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  45.52 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  40.27 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  35.38 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  39.14 
 
 		 349 aa  215  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  41.24 
 
 		 343 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  35.89 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  35.89 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  37.31 
 
 		 350 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  39.32 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.63 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  36.8 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.31 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  37.31 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  37.58 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  37.31 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  37.31 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  37.31 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  37.31 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  35.58 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  37.31 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  37.31 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  40.35 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3754  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  41.24 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3932  ribosome-associated GTPase  39.39 
 
 		 349 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  42.51 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  36.9 
 
 		 347 aa  208  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  35.67 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  40.89 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  36.73 
 
 		 350 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.23 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  36.73 
 
 		 350 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  36.73 
 
 		 350 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  42.51 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  34.88 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  38.18 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  36.73 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  36.73 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  36.73 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  37.61 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  37.61 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  37.61 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  39.32 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  37.61 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  37.61 
 
 		 350 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  41.92 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  39.06 
 
 		 343 aa  205  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  36.86 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  37.29 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  35.76 
 
 		 354 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0347  ribosome-associated GTPase  37.35 
 
 		 358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0044619  unclonable  0.00000256254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  37.07 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36.59 
 
 		 351 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.44 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1568  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.33 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  38.54 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2668  hypothetical protein  34.74 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2799  hypothetical protein  34.74 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.86 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  37.62 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  36.04 
 
 		 319 aa  169  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2914  putative ATP/GTP-binding protein  38.18 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.589504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0940  ribosome-associated GTPase  36.79 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0176411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  34.66 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.29 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  36.81 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  36.99 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  38.28 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 315 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.493781 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.59 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.25 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  36.16 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  36.16 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  36.16 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  35.44 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  35.85 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  35.85 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  36.4 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  35.41 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  35.85 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  36.26 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3146  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.33 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.79305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>