More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3112 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3112  GTPase EngC  100 
 
 		 261 aa  488  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  83.08 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  54.44 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.95 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  45.35 
 
 		 358 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45 
 
 		 364 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  36.68 
 
 		 351 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  36.09 
 
 		 365 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  45.75 
 
 		 372 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.25 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.56 
 
 		 367 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  45.83 
 
 		 344 aa  161  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  44.75 
 
 		 360 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  40.45 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  50.77 
 
 		 341 aa  159  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  34.38 
 
 		 364 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  34.38 
 
 		 364 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  33.98 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  34.38 
 
 		 364 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  50.75 
 
 		 352 aa  158  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  34.38 
 
 		 364 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  33.98 
 
 		 349 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  33.98 
 
 		 349 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  33.98 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  33.98 
 
 		 349 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  32.81 
 
 		 349 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  36.86 
 
 		 369 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.21 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.32 
 
 		 359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.93 
 
 		 367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  48.66 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.03 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.86 
 
 		 358 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.59 
 
 		 354 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.06 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.26 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.23 
 
 		 359 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.98 
 
 		 343 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  34.24 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  35.74 
 
 		 347 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  38.08 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  41.1 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.09 
 
 		 355 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.72 
 
 		 333 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  36.8 
 
 		 356 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  39.46 
 
 		 358 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.71 
 
 		 355 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.2 
 
 		 386 aa  131  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.41 
 
 		 394 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  38.7 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  34.88 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.85 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  45.36 
 
 		 350 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.5 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 396 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  33.46 
 
 		 373 aa  126  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  40.17 
 
 		 355 aa  126  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.62 
 
 		 350 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  37.5 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  33.84 
 
 		 350 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  38.61 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  42.21 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.21 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  33.89 
 
 		 351 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  35.94 
 
 		 395 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  37.45 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  34.9 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  39.18 
 
 		 357 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  36.06 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.59 
 
 		 349 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 358 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  40.82 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  36.93 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  34.77 
 
 		 347 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  26.47 
 
 		 363 aa  116  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  35.69 
 
 		 332 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  29.28 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  36.7 
 
 		 350 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  31.42 
 
 		 356 aa  109  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  39.9 
 
 		 346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  34.02 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  41.84 
 
 		 348 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  28.81 
 
 		 352 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.78 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  27.86 
 
 		 364 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  37.78 
 
 		 343 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  36.1 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  36.33 
 
 		 346 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  36.11 
 
 		 343 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  35.14 
 
 		 343 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  35.14 
 
 		 343 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  35.14 
 
 		 343 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  37.43 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  31.78 
 
 		 394 aa  90.1  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  34.83 
 
 		 343 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  31.11 
 
 		 352 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  29.82 
 
 		 337 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  34.27 
 
 		 343 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.54 
 
 		 348 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>