More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4196 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 348 aa  678    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  60.99 
 
 		 333 aa  345  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.75 
 
 		 339 aa  338  9e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  62.66 
 
 		 335 aa  336  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  57.82 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  60.65 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  56.18 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  55.72 
 
 		 343 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  55.39 
 
 		 344 aa  323  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.59 
 
 		 351 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  53.89 
 
 		 343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  59.94 
 
 		 331 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  55.49 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  55.79 
 
 		 336 aa  309  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  57.05 
 
 		 326 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  58.8 
 
 		 330 aa  308  9e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  56.59 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  56.72 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  58.64 
 
 		 328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  59.14 
 
 		 326 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  53.49 
 
 		 374 aa  299  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.14 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  54.52 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  57.81 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  57.81 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  57.28 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  51.46 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.89 
 
 		 355 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  57.7 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  49.72 
 
 		 371 aa  292  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  53.24 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  57.67 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.45 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  49.57 
 
 		 371 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  51 
 
 		 368 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  52.68 
 
 		 337 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  37.84 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  35.05 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  32.62 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  40.73 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.12 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  41.08 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.95 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  41.08 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  41.08 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.81 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  36.9 
 
 		 351 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.35 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.12 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  36.47 
 
 		 319 aa  133  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  36.39 
 
 		 313 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  36.08 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  36.08 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  40.25 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.06 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  40.61 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  35.88 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  35.9 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  34.47 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  35.9 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  35.9 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  38.24 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  35.44 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  35.16 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  35.44 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  35.44 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  35.13 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  39.8 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  36.8 
 
 		 342 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.2 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.02 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  36.44 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  38.18 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  36.4 
 
 		 354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  31.53 
 
 		 349 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  35.55 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.43 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  35.32 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  35.56 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  34.28 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  30.3 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  34.28 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  34.28 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  40.91 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.16 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.16 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.16 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.16 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>