More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1383 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  100 
 
 		 343 aa  667    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  59.44 
 
 		 350 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.65 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  60.47 
 
 		 331 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  60.24 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  55.68 
 
 		 353 aa  352  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  59.02 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  58 
 
 		 374 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.52 
 
 		 351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  55.91 
 
 		 349 aa  342  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.59 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  53.78 
 
 		 343 aa  339  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  59.27 
 
 		 335 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  54.24 
 
 		 371 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  57.26 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  54.24 
 
 		 371 aa  335  7e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  59.87 
 
 		 326 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  57.23 
 
 		 344 aa  332  8e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  59.05 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  59.05 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  60.62 
 
 		 334 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  54.52 
 
 		 326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  58.18 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  56.5 
 
 		 330 aa  322  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  54.62 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  56.07 
 
 		 326 aa  316  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  55.69 
 
 		 355 aa  316  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  53.08 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.52 
 
 		 348 aa  305  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.41 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  55.34 
 
 		 368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  54.35 
 
 		 339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  54.09 
 
 		 328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.59 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.54 
 
 		 355 aa  295  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  54.49 
 
 		 337 aa  279  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.4 
 
 		 319 aa  146  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.02 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.01 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.45 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.51 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.6 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  34.62 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.57 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.63 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  34.26 
 
 		 343 aa  126  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  31.25 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.4 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  37.7 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.24 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.34 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  36.33 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.96 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.96 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  34.55 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  35.71 
 
 		 343 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  36.86 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.29 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  36 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  37.87 
 
 		 352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.43 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.43 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.43 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.43 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  36.69 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  35.77 
 
 		 352 aa  119  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  33.53 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  36.11 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.79 
 
 		 293 aa  119  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  31.38 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.79 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  31.46 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  36.4 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  29.21 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.2 
 
 		 292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  35.4 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  33.53 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  34.01 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  36.59 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  34.29 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  34.29 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  34.29 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  32.93 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  31.35 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  35.69 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.67 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  34.67 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  35.11 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  31.95 
 
 		 289 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>