More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1770 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  100 
 
 		 326 aa  633  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  89.49 
 
 		 326 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  84.97 
 
 		 326 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  85.85 
 
 		 326 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  85.85 
 
 		 326 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  82.32 
 
 		 330 aa  477  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  73.77 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  75.23 
 
 		 330 aa  450  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  64.6 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  66.34 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.92 
 
 		 339 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  55.36 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.04 
 
 		 351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  54.41 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  52.29 
 
 		 350 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  53.49 
 
 		 344 aa  311  7.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  56.76 
 
 		 369 aa  310  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  52.57 
 
 		 353 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  57.14 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  55.04 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.47 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  57.05 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  54.74 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.27 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  54.32 
 
 		 331 aa  297  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.68 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  55.09 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.59 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  51.29 
 
 		 355 aa  294  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  53.87 
 
 		 366 aa  293  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  51.13 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  50.57 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  53.33 
 
 		 334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  54.98 
 
 		 334 aa  275  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  51.09 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  54.02 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.74 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  40.25 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  34.81 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  40.25 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.97 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  38.35 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.8 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  39 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  31.1 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  38.56 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  37.27 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.56 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  34.93 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  35.08 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  36.89 
 
 		 354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.18 
 
 		 354 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.18 
 
 		 354 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  34.68 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.18 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  32 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.18 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.7 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  32.18 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  31.43 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  36.16 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  26.94 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.26 
 
 		 375 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.3 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  35.64 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.36 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  35.84 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.71 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  37.19 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  33.64 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  37.74 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  35.68 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  35.68 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  33.04 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  36.77 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  35.68 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.59 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  32 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  31.08 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  31.08 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  36.82 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  31.68 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  35.2 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.16 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.07 
 
 		 359 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 		 353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>