More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1379 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  100 
 
 		 326 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  100 
 
 		 326 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  98.47 
 
 		 326 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  83.39 
 
 		 326 aa  508  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  86.58 
 
 		 326 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  79.74 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  77.16 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  71.21 
 
 		 343 aa  444  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  63.98 
 
 		 333 aa  404  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  65.58 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  58.08 
 
 		 343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.85 
 
 		 339 aa  348  8e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.73 
 
 		 351 aa  325  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  51.16 
 
 		 350 aa  318  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  56.89 
 
 		 374 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  53.19 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  53.22 
 
 		 344 aa  312  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  57.98 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  51.73 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  57.68 
 
 		 361 aa  309  4e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  56.52 
 
 		 328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.44 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  51.41 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.97 
 
 		 355 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.82 
 
 		 348 aa  298  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.07 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  55.23 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  49.29 
 
 		 371 aa  295  8e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  53.63 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  52.78 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  52.6 
 
 		 336 aa  292  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  50.6 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  51.15 
 
 		 355 aa  288  9e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  57.33 
 
 		 334 aa  276  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  51.74 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  51.77 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  40.31 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  40.31 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  38.95 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  40.31 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  40.31 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  40.5 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  40.38 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  40.38 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  40.38 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  39.67 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  40.08 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  40.08 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  40.08 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  39.67 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  39.15 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  36.7 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.02 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.33 
 
 		 375 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  34.93 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  33.06 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  30.15 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  34.69 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  30.2 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  37.71 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  33.63 
 
 		 289 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.51 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  37.29 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.68 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.83 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  36.79 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  34.87 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.79 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.79 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  34.17 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.48 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  36.79 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  33.03 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  36 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  33.49 
 
 		 352 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  31.3 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.19 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  29.7 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  31.13 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  34.26 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  36.32 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  30.83 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.19 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.46 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  36.22 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  35.64 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.56 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  34.14 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  31.03 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.34 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  35.1 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>