More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8329 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  100 
 
 		 350 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  76.06 
 
 		 351 aa  477  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  67.73 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  62.07 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  59.78 
 
 		 353 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  59.44 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  61.45 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  61.52 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  61.47 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  60.69 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.64 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  62.21 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  59 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  58.38 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  61.08 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  56.22 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  54.73 
 
 		 336 aa  348  9e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  55.68 
 
 		 330 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.85 
 
 		 355 aa  345  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  58.77 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  58.36 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  55.06 
 
 		 366 aa  333  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  51.61 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  56.14 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  51.22 
 
 		 371 aa  329  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  60 
 
 		 337 aa  326  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  54.03 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  52.16 
 
 		 343 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  51.98 
 
 		 326 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.71 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.51 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  53.09 
 
 		 326 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  53.09 
 
 		 326 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  52.62 
 
 		 326 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  52.57 
 
 		 326 aa  292  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  52.74 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.36 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  39.47 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  39.47 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  39.47 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  39.1 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  39.1 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  37.32 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  39.47 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  39.1 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  38.72 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  37.69 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  38.81 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  38.15 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.94 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  38.15 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  38.15 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  35.06 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  36.57 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  36.57 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  34.66 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  36.57 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  36.57 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  37.87 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  34.94 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  34.93 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.94 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  40.23 
 
 		 334 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  35.32 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  34.59 
 
 		 342 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  35.66 
 
 		 354 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36.19 
 
 		 351 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  39.85 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  36.23 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.59 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  36.23 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  36.23 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  34.97 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.98 
 
 		 319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.82 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.07 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  36.03 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  36.06 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  39.05 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  31.34 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  35.19 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.45 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  37.7 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  35.79 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.08 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  35.42 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  35.56 
 
 		 349 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  33.45 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  35.93 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.35 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  35.79 
 
 		 350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>