More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1206 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  100 
 
 		 361 aa  689    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  73.56 
 
 		 344 aa  461  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  64.62 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  62.87 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  67.05 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  61.22 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  59.71 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  56.49 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  57.88 
 
 		 349 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  57.71 
 
 		 343 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  56.01 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.88 
 
 		 333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  60.71 
 
 		 351 aa  338  9e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  60.76 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  59.59 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  57.28 
 
 		 343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  51.71 
 
 		 371 aa  325  7e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  59.25 
 
 		 335 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  51.43 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.17 
 
 		 339 aa  317  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  58.31 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.94 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  60.92 
 
 		 337 aa  315  8e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.9 
 
 		 366 aa  315  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  56.52 
 
 		 328 aa  302  7.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  55.76 
 
 		 326 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  57.68 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  57.68 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  55.46 
 
 		 374 aa  298  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  55.22 
 
 		 334 aa  298  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  57.23 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  56.74 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  57.23 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  50.28 
 
 		 336 aa  292  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.12 
 
 		 355 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.76 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.89 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  36.6 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  36.36 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  35.86 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  30.14 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  36.58 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  33.98 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  33.33 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.81 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.81 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.81 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.81 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  37.93 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  35.14 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  33.07 
 
 		 351 aa  122  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  28.78 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.31 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  35.02 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.68 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  33.33 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  38.76 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.07 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.17 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  33.08 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.07 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.17 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  37.02 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  39 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  39 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  35.02 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  35.02 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  35.02 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  35.02 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  39 
 
 		 354 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.96 
 
 		 375 aa  119  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  37.91 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  35.02 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  35.14 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  35.14 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  37.55 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  37.32 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  35.14 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.62 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.56 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  34.24 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  33.76 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  34.24 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  34.24 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  34.24 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  34.24 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  34.24 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  34.24 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.85 
 
 		 350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  33.85 
 
 		 350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  31 
 
 		 340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.98 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  38.76 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  29.11 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.1 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.32 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.16 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  39.06 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>