More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7891 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  100 
 
 		 349 aa  700    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  62.07 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  65.36 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  62.84 
 
 		 351 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  62.09 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  56.18 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  58.82 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  55.74 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  58.53 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  61.51 
 
 		 339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  61.72 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  60.06 
 
 		 333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.18 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  57.44 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  57.59 
 
 		 361 aa  347  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  63.2 
 
 		 334 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  55.52 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  55.91 
 
 		 343 aa  342  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  58.04 
 
 		 334 aa  340  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  62.46 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  56.93 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  58.13 
 
 		 335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  55.18 
 
 		 355 aa  322  8e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.98 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  53.85 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  54.65 
 
 		 374 aa  319  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.82 
 
 		 348 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  55.56 
 
 		 326 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  52.17 
 
 		 368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  54.95 
 
 		 330 aa  298  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  56.03 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.33 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  55.05 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  55.05 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  55.05 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  54.87 
 
 		 330 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.31 
 
 		 319 aa  159  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  41.28 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  41.28 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  42.2 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  39.47 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  40.37 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  39.47 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  39.47 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  43.44 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  35.08 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.19 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  35.08 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.65 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.88 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  34.2 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  34.09 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  34.49 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  40.15 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  41.67 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.2 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  34.57 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  30.93 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  39.77 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.34 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  32.84 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.16 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  30.29 
 
 		 351 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  35.25 
 
 		 352 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 		 354 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.08 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.58 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 		 354 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.62 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.13 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  33.83 
 
 		 352 aa  122  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  35.54 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.19 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  35.54 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  35.54 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  35.54 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  32.95 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  32.95 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  35.54 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  32.95 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  32.95 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  32.2 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.66 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.16 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  31.44 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  35.77 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  31.88 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  31.88 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  35.39 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  38.06 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  31.88 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>