More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3719 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  100 
 
 		 374 aa  733    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  87.65 
 
 		 334 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  65.31 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  61.47 
 
 		 350 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  61.42 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  58 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  61.34 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  57.78 
 
 		 353 aa  354  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  61.76 
 
 		 331 aa  349  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.64 
 
 		 338 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  57.7 
 
 		 369 aa  338  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  56.69 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  56.7 
 
 		 344 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  60.94 
 
 		 335 aa  335  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  53.37 
 
 		 343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  55.74 
 
 		 355 aa  326  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  55.46 
 
 		 361 aa  318  7.999999999999999e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  57.69 
 
 		 330 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  59.16 
 
 		 326 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  59.16 
 
 		 326 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  58.84 
 
 		 326 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  60 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.02 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  56.59 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  55.95 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  51.66 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.36 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  56.69 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  58.33 
 
 		 330 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  56.32 
 
 		 334 aa  300  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  52.99 
 
 		 368 aa  300  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  49.86 
 
 		 371 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  52.05 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  55.8 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.86 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  48.97 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.81 
 
 		 316 aa  150  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.64 
 
 		 319 aa  146  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  40.07 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  40 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  38.91 
 
 		 343 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  36.82 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  35.25 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  35.25 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  34.15 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.51 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  35.25 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  33.63 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  30.57 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.83 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  39.62 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  36.07 
 
 		 343 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  40.81 
 
 		 343 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  36.16 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.77 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  34.3 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  32 
 
 		 311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.84 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  39.26 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.56 
 
 		 354 aa  125  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  41.15 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  41.15 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.57 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  34.67 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  32.97 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.63 
 
 		 292 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  35 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  36.13 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  33.78 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  33.78 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  33.78 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  33.78 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  37.61 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  34.18 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.93 
 
 		 375 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  40.09 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  34.18 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.76 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  35.62 
 
 		 364 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  29.94 
 
 		 351 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  34.17 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.493781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  35.89 
 
 		 289 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.78 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  34.06 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  34.41 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.99 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  33.81 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  33 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.25 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  33.94 
 
 		 313 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  33.45 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  34.34 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 		 350 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 		 350 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 		 350 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  34.04 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  32.86 
 
 		 350 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.94 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>