More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1204 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 293 aa  578  1e-164  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.24 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.29 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.99 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  37.72 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  37.72 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  30.69 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  34.49 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  34.69 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  32.67 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  32.67 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  32.44 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  31.15 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.13 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  32.87 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  31.67 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  31.67 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  31.67 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  31.67 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  31.67 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  31.67 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  31.67 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  32 
 
 		 293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  32.64 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  31.71 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.33 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.73 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.88 
 
 		 290 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.08 
 
 		 291 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.99 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  32.11 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.38 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  27.61 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  34.6 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.77 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  25.95 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  32.88 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.1 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  34.22 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  31.1 
 
 		 374 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.22 
 
 		 290 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.07 
 
 		 370 aa  135  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.26 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.69 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.69 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  27.88 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.04 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.23 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.55 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  31.74 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  30.28 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  28.18 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  27.72 
 
 		 364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.05 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00181  GTPase  33.83 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00181  GTPase  33.89 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1346  GTPase EngC  34.78 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.497247  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0019  GTPase EngC  32.03 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.54 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  25.95 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  34.14 
 
 		 373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  25.09 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  27.27 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00181  GTPases  35.59 
 
 		 312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.712591  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.2 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  30 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0026  GTPase EngC  26.4 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1480  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.05 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137644  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  29.69 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00191  GTPase  29.73 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.0640635 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0022  GTPase EngC  28.12 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  26.69 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  27.93 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  27.24 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  29.18 
 
 		 405 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1409  GTPase EngC  28.25 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0882  ribosome-associated GTPase  26.34 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.493781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0811  ribosome-associated GTPase  25.56 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  26.69 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  27.24 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  26.69 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  26.14 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.08 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00181  GTPases  31.83 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.655275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  25 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  31.27 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  25 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  26.92 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  26.73 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  28.86 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  27.11 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0940  ribosome-associated GTPase  25.7 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0176411 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  25.09 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.8 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  25.94 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  29.27 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  26.83 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  28.86 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  28.86 
 
 		 364 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  25.4 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>