More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2049 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2049  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 783 aa  1569    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  32.34 
 
 		 794 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 779 aa  320  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 862 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2052  MscS Mechanosensitive ion channel  24.53 
 
 		 810 aa  211  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 833 aa  208  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  27.7 
 
 		 813 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  22.89 
 
 		 842 aa  144  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.68 
 
 		 806 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 843 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  33.5 
 
 		 439 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 		 437 aa  120  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  26.27 
 
 		 983 aa  116  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  38.36 
 
 		 891 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  26.27 
 
 		 983 aa  116  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 785 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1104 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 440 aa  114  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1115 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 860 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 299 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1108 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1108 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1108 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1108 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1108 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 		 685 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 732 aa  110  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1103 aa  110  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.5 
 
 		 1144 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  28.94 
 
 		 830 aa  109  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1107 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  31.61 
 
 		 1080 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  30.85 
 
 		 1107 aa  107  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 		 1107 aa  107  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1107 aa  107  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1107 aa  107  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1107 aa  107  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1107 aa  107  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1107 aa  107  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1107 aa  107  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1107 aa  107  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  31.01 
 
 		 753 aa  107  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  26.59 
 
 		 1115 aa  107  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  26.22 
 
 		 1118 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 636 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  33.55 
 
 		 1067 aa  105  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  26.22 
 
 		 1120 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  26.22 
 
 		 1118 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 1068 aa  105  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  26.22 
 
 		 1118 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  26.22 
 
 		 1120 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1107 aa  105  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 636 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  33.55 
 
 		 1067 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  33.55 
 
 		 1067 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  33.55 
 
 		 1067 aa  105  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  25.94 
 
 		 1120 aa  104  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  25.94 
 
 		 1120 aa  104  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 867 aa  103  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1120 aa  104  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 1067 aa  104  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1120 aa  104  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1120 aa  104  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1120 aa  104  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1120 aa  104  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1120 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  33.57 
 
 		 1072 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1107 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  36.54 
 
 		 909 aa  103  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  33.57 
 
 		 1072 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 1072 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  29.13 
 
 		 825 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1118 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 		 444 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 832 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 843 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  35.9 
 
 		 909 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 1078 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 472 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  38.02 
 
 		 291 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  35.9 
 
 		 947 aa  103  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 840 aa  103  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  33.13 
 
 		 910 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 322 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  33.57 
 
 		 1062 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 432 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  24.29 
 
 		 825 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 1060 aa  101  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  29.46 
 
 		 301 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 1066 aa  101  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  34.44 
 
 		 849 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  34.44 
 
 		 847 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  34.44 
 
 		 847 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 1070 aa  101  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  27.43 
 
 		 1133 aa  100  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 845 aa  100  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  24.61 
 
 		 844 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>