More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0555 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0555  ribonuclease E  100 
 
 		 608 aa  1238    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0470  ribonuclease  92.93 
 
 		 606 aa  1137    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0929  ribonuclease, Rne/Rng family protein  51.64 
 
 		 587 aa  607  9.999999999999999e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.251071  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1296  ribonuclease E  42.4 
 
 		 890 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.17459  normal  0.956429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2149  RNAse E  42.75 
 
 		 889 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3278  ribonuclease  41.55 
 
 		 863 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.027998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2131  RNAse E  37.5 
 
 		 936 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162164  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0806  ribonuclease  37.5 
 
 		 890 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0942815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1711  ribonuclease E  39.02 
 
 		 868 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296054  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0716  ribonuclease  37.61 
 
 		 869 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.695847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0589  ribonuclease, Rne/Rng family  38.8 
 
 		 1009 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000676969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2572  ribonuclease  41.19 
 
 		 905 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1776  ribonuclease E  38.09 
 
 		 984 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000943072  decreased coverage  0.00020345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  38.15 
 
 		 1071 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  37.54 
 
 		 1073 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3946  ribonuclease, Rne/Rng family  42.22 
 
 		 1065 aa  369  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.213913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6047  ribonuclease, Rne/Rng family  42.89 
 
 		 1045 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3659  ribonuclease  42.57 
 
 		 1049 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3952  ribonuclease, Rne/Rng family  42.57 
 
 		 1046 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0825957  normal  0.60191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0393  ribonuclease  42.89 
 
 		 1092 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1040  ribonuclease E protein  37.71 
 
 		 1014 aa  364  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2275  RNAse E  37.71 
 
 		 1042 aa  364  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896581  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2539  ribonuclease E  42.96 
 
 		 890 aa  364  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.915754  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2318  ribonuclease E  43.51 
 
 		 935 aa  363  6e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4649  ribonuclease  41.48 
 
 		 1043 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332201 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0389  ribonuclease  37.15 
 
 		 879 aa  362  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.57215  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2965  ribonuclease  42.86 
 
 		 869 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0116298  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2440  RNAse E  37.34 
 
 		 1037 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4204  ribonuclease E  42.68 
 
 		 1070 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0396  ribonuclease, Rne/Rng family  37.15 
 
 		 865 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1756  ribonuclease, Rne/Rng family  37.89 
 
 		 1016 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000532878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3848  RNAse E  44.04 
 
 		 880 aa  356  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1064  ribonuclease  37.48 
 
 		 977 aa  356  7.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.973146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2340  ribonuclease  43.64 
 
 		 1026 aa  356  7.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114926  normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3172  ribonuclease  42.04 
 
 		 881 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0592866  normal  0.271417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0656  ribonuclease E  37.15 
 
 		 998 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.4 
 
 		 808 aa  350  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0931  ribonuclease  42.33 
 
 		 1005 aa  350  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1353  ribonuclease E  37.87 
 
 		 938 aa  350  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000765938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4668  ribonuclease  41.75 
 
 		 1080 aa  349  7e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.156996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1393  ribonuclease, Rne/Rng family  44.56 
 
 		 953 aa  349  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  unclonable  0.000000823933  normal  0.119255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2728  ribonuclease, Rne/Rng family  41.44 
 
 		 1053 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1302  ribonuclease, Rne/Rng family  44.82 
 
 		 965 aa  349  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000158665  normal  0.0123334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2854  ribonuclease  41.44 
 
 		 1029 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.541303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0957  ribonuclease  44.56 
 
 		 944 aa  346  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545354  normal  0.0139882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0729  ribonuclease, Rne/Rng family  41.73 
 
 		 1080 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.410807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  36.16 
 
 		 806 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2442  ribonuclease  40.94 
 
 		 1043 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3009  ribonuclease  40.94 
 
 		 1060 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00611074  normal  0.333184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1459  RNAse E  41.73 
 
 		 976 aa  343  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.00000280055  normal  0.379566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2268  ribonuclease  41.67 
 
 		 926 aa  342  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.78941  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1822  ribonuclease  40.69 
 
 		 1039 aa  342  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0908  ribonuclease Rne/Rng domain-containing protein  41.16 
 
 		 891 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000577362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  35.82 
 
 		 926 aa  342  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0912  ribonuclease Rne/Rng domain-containing protein  40.91 
 
 		 922 aa  340  7e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00607829  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1794  ribonuclease E  43.78 
 
 		 1035 aa  338  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.713418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  34.07 
 
 		 866 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1720  ribonuclease E and G  40.69 
 
 		 1059 aa  337  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325079  normal  0.0192553 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  43.54 
 
 		 1065 aa  334  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0818  ribonuclease  43.37 
 
 		 1092 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00158382  normal  0.513461 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0388  ribonuclease  39.4 
 
 		 906 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1707  ribonuclease E  43.11 
 
 		 1068 aa  329  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000337375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2922  ribonuclease, Rne/Rng family  42.86 
 
 		 1097 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000705961  normal  0.54344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1062  ribonuclease E  42.86 
 
 		 1096 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  0.00000580995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  42.86 
 
 		 1111 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1242  ribonuclease  44.33 
 
 		 928 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2134  ribonuclease  43.83 
 
 		 1070 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0520  ribonuclease E  42.86 
 
 		 1090 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000787566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2918  ribonuclease E  42.86 
 
 		 1085 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000100731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1814  ribonuclease E  42.86 
 
 		 1087 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0112079  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2791  ribonuclease E  42.86 
 
 		 1087 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000882056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  42.6 
 
 		 1059 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0986  ribonuclease  42.6 
 
 		 1068 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2491  ribonuclease E  42.86 
 
 		 1090 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172006  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1069  ribonuclease  42.86 
 
 		 1056 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17751  decreased coverage  0.00648425 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2863  ribonuclease E  42.86 
 
 		 1088 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2802  ribonuclease E  42.86 
 
 		 1088 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000361809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1110  ribonuclease  42.86 
 
 		 1059 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0631  ribonuclease  42.86 
 
 		 1059 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0577121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  42.86 
 
 		 1053 aa  327  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1321  ribonuclease E  40.29 
 
 		 904 aa  327  6e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0034947  normal  0.881501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  43.9 
 
 		 1012 aa  327  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0970  ribonuclease, Rne/Rng family  42.82 
 
 		 1008 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2678  ribonuclease, Rne/Rng family  42.01 
 
 		 1091 aa  324  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.174133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0905  ribonuclease, Rne/Rng family  42.82 
 
 		 1011 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0755598  normal  0.0613595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002988  ribonuclease E  44.56 
 
 		 1024 aa  323  7e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  43.22 
 
 		 1015 aa  323  8e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  42.12 
 
 		 938 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  37.25 
 
 		 1072 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2244  ribonuclease E  45.76 
 
 		 663 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2216  ribonuclease E  45.76 
 
 		 663 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  44.1 
 
 		 1035 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  43.2 
 
 		 1128 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  43.2 
 
 		 1120 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  43.09 
 
 		 1238 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1898  ribonuclease E  43.35 
 
 		 1122 aa  320  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000446531  hitchhiker  0.000483574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  43.77 
 
 		 968 aa  320  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  42.82 
 
 		 1074 aa  320  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2187  ribonuclease E  43.35 
 
 		 1068 aa  319  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.33181  hitchhiker  0.00000000773492 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  41.88 
 
 		 1132 aa  319  9e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>