More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0929 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0929  ribonuclease, Rne/Rng family protein  100 
 
 		 587 aa  1194    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.251071  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0470  ribonuclease  51.57 
 
 		 606 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0555  ribonuclease E  51.55 
 
 		 608 aa  599  1e-170  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3278  ribonuclease  36.63 
 
 		 863 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.027998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1711  ribonuclease E  36.99 
 
 		 868 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296054  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0589  ribonuclease, Rne/Rng family  37.91 
 
 		 1009 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000676969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2149  RNAse E  38.84 
 
 		 889 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1296  ribonuclease E  39.34 
 
 		 890 aa  401  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.17459  normal  0.956429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2572  ribonuclease  41.9 
 
 		 905 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0656  ribonuclease E  36.99 
 
 		 998 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59395 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  37.06 
 
 		 1065 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0592  ribonuclease  38.15 
 
 		 1058 aa  369  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0452769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1600  ribonuclease E  39.22 
 
 		 1048 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  37.52 
 
 		 968 aa  363  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  36.75 
 
 		 866 aa  362  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1282  ribonuclease E  38.63 
 
 		 1068 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783205  hitchhiker  0.0000048225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1253  ribonuclease E  38.63 
 
 		 1067 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2187  ribonuclease E  38.63 
 
 		 1068 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.33181  hitchhiker  0.00000000773492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1297  ribonuclease E  38.63 
 
 		 1067 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148033 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2003  ribonuclease E  38.63 
 
 		 1067 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1463  ribonuclease E  38.43 
 
 		 1061 aa  359  8e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00215249  hitchhiker  0.000000103406 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2562  ribonuclease, Rne/Rng family  38.43 
 
 		 1061 aa  359  9e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000807422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1207  ribonuclease E  38.43 
 
 		 1061 aa  359  9e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01080  fused ribonucleaseE: endoribonuclease/RNA-binding protein/RNA degradosome binding protein  38.43 
 
 		 1061 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00444981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  36.65 
 
 		 1059 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1207  ribonuclease E  38.43 
 
 		 1061 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2516  ribonuclease E  38.43 
 
 		 1061 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000196842  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2042  ribonuclease E  38.43 
 
 		 1057 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000184616  hitchhiker  0.00765925 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01088  hypothetical protein  38.43 
 
 		 1061 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00236445  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  37.65 
 
 		 1071 aa  359  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  36.33 
 
 		 1015 aa  358  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  36.21 
 
 		 942 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  36.2 
 
 		 1072 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2643  ribonuclease, Rne/Rng family  36.22 
 
 		 1029 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0703  ribonuclease  35.24 
 
 		 752 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  36.41 
 
 		 1074 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5282  ribonuclease  36.85 
 
 		 1044 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0972122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2241  ribonuclease E  38.24 
 
 		 1061 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000115068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3290  ribonuclease E  36.22 
 
 		 1025 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0986  ribonuclease  36.46 
 
 		 1068 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  37.03 
 
 		 1012 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  36.46 
 
 		 1053 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  36.1 
 
 		 1111 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0818  ribonuclease  36.28 
 
 		 1092 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00158382  normal  0.513461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1062  ribonuclease E  36.46 
 
 		 1096 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  0.00000580995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1069  ribonuclease  36.1 
 
 		 1056 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17751  decreased coverage  0.00648425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0631  ribonuclease  36.1 
 
 		 1059 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0577121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1110  ribonuclease  36.1 
 
 		 1059 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2922  ribonuclease, Rne/Rng family  36.46 
 
 		 1097 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000705961  normal  0.54344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  36.07 
 
 		 1139 aa  356  7.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2289  ribonuclease E  37.31 
 
 		 1004 aa  355  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2475  RNAse E  36.2 
 
 		 1095 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.350754  normal  0.0309861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  35.78 
 
 		 1141 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0520  ribonuclease E  35.91 
 
 		 1090 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000787566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2863  ribonuclease E  35.91 
 
 		 1088 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1814  ribonuclease E  35.91 
 
 		 1087 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0112079  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2791  ribonuclease E  35.91 
 
 		 1087 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000882056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2491  ribonuclease E  35.91 
 
 		 1090 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0905  ribonuclease, Rne/Rng family  36.03 
 
 		 1011 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0755598  normal  0.0613595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3086  ribonuclease  35.42 
 
 		 1076 aa  354  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2802  ribonuclease E  35.91 
 
 		 1088 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000361809  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1707  ribonuclease E  35.82 
 
 		 1068 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000337375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2567  RNAse E  36.2 
 
 		 1098 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2405  RNAse E  36.2 
 
 		 1093 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.133315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1173  ribonuclease E  35.86 
 
 		 1040 aa  353  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  37.48 
 
 		 1073 aa  353  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0716  ribonuclease  39.91 
 
 		 869 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.695847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3952  ribonuclease, Rne/Rng family  40.85 
 
 		 1046 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0825957  normal  0.60191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3659  ribonuclease  40.85 
 
 		 1049 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.41 
 
 		 1128 aa  353  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  36.41 
 
 		 1120 aa  353  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0282  ribonuclease  35.73 
 
 		 1449 aa  353  7e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.936888  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2785  ribonuclease E  36.01 
 
 		 1088 aa  352  8e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2275  RNAse E  36.23 
 
 		 1042 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2918  ribonuclease E  35.82 
 
 		 1085 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000100731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2539  ribonuclease E  42.47 
 
 		 890 aa  352  8e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.915754  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0256  RNAse E  35.73 
 
 		 1405 aa  352  8.999999999999999e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0806  ribonuclease  42.22 
 
 		 890 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0942815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1040  ribonuclease E protein  35.48 
 
 		 1014 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2843  ribonuclease E and G  35.75 
 
 		 764 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  36.64 
 
 		 1082 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2131  RNAse E  42.22 
 
 		 936 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1898  ribonuclease E  38.16 
 
 		 1122 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000446531  hitchhiker  0.000483574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  36.26 
 
 		 1073 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3660  ribonuclease E  36.04 
 
 		 1041 aa  352  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  35.6 
 
 		 1102 aa  352  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2440  RNAse E  35.86 
 
 		 1037 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  36.28 
 
 		 1057 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1573  ribonuclease  35.09 
 
 		 1128 aa  351  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0970  ribonuclease, Rne/Rng family  35.49 
 
 		 1008 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3946  ribonuclease, Rne/Rng family  40.61 
 
 		 1065 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.213913 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1750  ribonuclease  35.25 
 
 		 1158 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00127119  normal  0.447333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1720  ribonuclease  35.5 
 
 		 1007 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3848  RNAse E  42.64 
 
 		 880 aa  350  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  37.2 
 
 		 1056 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  36.45 
 
 		 1035 aa  350  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2005  ribonuclease E  34.64 
 
 		 870 aa  350  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2657  ribonuclease, Rne/Rng family  35.25 
 
 		 1154 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00498519  hitchhiker  0.000418055 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1707  ribonuclease  35.83 
 
 		 1148 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000116835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1710  ribonuclease  35.25 
 
 		 1144 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000580294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>