122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0935 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0935  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 410 aa  853    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0423027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0300  putative sensor with HAMP domain  38.01 
 
 		 405 aa  285  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  37.53 
 
 		 410 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  36.18 
 
 		 835 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 827 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0360  putative PAS/PAC sensor protein  50.6 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  27.93 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  28.47 
 
 		 302 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 803 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  60 
 
 		 217 aa  90.1  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3665  putative sensor with HAMP domain  23.51 
 
 		 301 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  53.16 
 
 		 204 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  23.45 
 
 		 800 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  53.16 
 
 		 204 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 872 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2773  hypothetical protein  48.53 
 
 		 192 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1339  PAS sensor protein  47.95 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 862 aa  84  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  26.77 
 
 		 882 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0276  putative sensor with HAMP domain protein  26.21 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0276  putative sensor with HAMP domain  26.21 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.529907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0846  response regulator receiver protein  53.12 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3116  histidine kinase  26.48 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  53.12 
 
 		 225 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4236  sensor protein  26.55 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0527  putative sensor with HAMP domain protein  23.96 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.15 
 
 		 858 aa  77.4  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  22.99 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0878  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 		 840 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00403234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1361  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 912 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  26.44 
 
 		 582 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  23.69 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1634  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 202 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  22.46 
 
 		 801 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 946 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1912  putative PAS/PAC sensor protein  46.15 
 
 		 201 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.436176  unclonable  0.00000739148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 		 810 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 812 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.98 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  29.11 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  29.58 
 
 		 910 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  24.13 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  42.86 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  29.6 
 
 		 822 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  25 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0105  hypothetical protein  23.33 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 238 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4067  sensor protein  25.87 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000038366 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  24.34 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  28 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  31.94 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  23.11 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  31.94 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.2 
 
 		 879 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  28 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2111  diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1554  GGDEF domain-containing protein  44.44 
 
 		 389 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  31.94 
 
 		 249 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  21.73 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  22.76 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  23.99 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1360  cellulose binding, type IV  30.66 
 
 		 544 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2114  protein serine/threonine phosphatase  36.46 
 
 		 666 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  25.34 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  22.53 
 
 		 560 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  23.66 
 
 		 245 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.9 
 
 		 573 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.6 
 
 		 815 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.76 
 
 		 720 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2356  protein serine/threonine phosphatase  27.39 
 
 		 679 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  27.2 
 
 		 661 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2661  diguanylate cyclase  27.48 
 
 		 644 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.646845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.61 
 
 		 541 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.36 
 
 		 541 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  23.04 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 579 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.71 
 
 		 561 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.66 
 
 		 1064 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.2 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  21.81 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 791 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 		 654 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 570 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  27.55 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  22.67 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  30.41 
 
 		 629 aa  47  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.66 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  27.22 
 
 		 600 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.61 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0339  methyl-accepting chemotaxis protein  23.2 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0342  methyl-accepting chemotaxis protein  23.2 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4900  methyl-accepting chemotaxis protein  23.2 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0405  methyl-accepting chemotaxis protein  23.2 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2964  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.67 
 
 		 564 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.551015 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.56 
 
 		 706 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>