More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0753 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 400 aa  816    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  51.65 
 
 		 405 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  49.24 
 
 		 407 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  48.86 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  47.15 
 
 		 399 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  47.43 
 
 		 399 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.4 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.42 
 
 		 700 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  24.76 
 
 		 560 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.47 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  23.47 
 
 		 534 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  26.94 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0276  putative sensor with HAMP domain protein  25.1 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0276  putative sensor with HAMP domain  25.1 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.529907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  24.04 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  21.83 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0527  putative sensor with HAMP domain protein  26.07 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.04 
 
 		 856 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  21.94 
 
 		 582 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  22.38 
 
 		 572 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  23.94 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  22.07 
 
 		 556 aa  73.2  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  28.8 
 
 		 187 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  22.3 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  24.31 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 		 862 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  25.77 
 
 		 835 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1550  putative PAS/PAC sensor protein  28.73 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.08 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 		 827 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  34.82 
 
 		 183 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.52 
 
 		 805 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  24.55 
 
 		 608 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 608 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  23.61 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 839 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000161  GGDEF family protein  29.48 
 
 		 652 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46573  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3665  putative sensor with HAMP domain  27.89 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  28 
 
 		 610 aa  62.8  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.38 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4236  sensor protein  24.47 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 731 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.9 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 632 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 897 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4067  sensor protein  23.4 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000038366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1184 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.17 
 
 		 1064 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  29.36 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  24 
 
 		 801 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2921  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 589 aa  61.6  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 845 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 736 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  24.66 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.93 
 
 		 656 aa  59.7  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.574957  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 678 aa  59.7  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  23.46 
 
 		 800 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 782 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  26.29 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 		 1127 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 749 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 		 881 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5751  diguanylate cyclase  24.47 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  26.96 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.11 
 
 		 603 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4510  putative CheA signal transduction histidine kinase  23.42 
 
 		 803 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05794  hypothetical protein  30.18 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  24.1 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 		 603 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1021  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.32 
 
 		 1051 aa  57.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0105  hypothetical protein  23.33 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1963  chemotaxis sensory transducer  22.35 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 621 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  21.33 
 
 		 600 aa  57  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 1078 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.66 
 
 		 1271 aa  56.6  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 		 1184 aa  56.6  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 		 785 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.74 
 
 		 853 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.86 
 
 		 539 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  34.83 
 
 		 762 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  25.9 
 
 		 613 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  25.9 
 
 		 613 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  25.9 
 
 		 613 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  25.9 
 
 		 613 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  44.29 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 816 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0055  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 193 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  30.32 
 
 		 185 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.05 
 
 		 614 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  25.9 
 
 		 613 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 604 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 890 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 781 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  25.9 
 
 		 613 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  25.9 
 
 		 613 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>