163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4236 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4236  sensor protein  100 
 
 		 291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3116  histidine kinase  49.68 
 
 		 325 aa  316  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4067  sensor protein  45.02 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000038366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0105  hypothetical protein  44.14 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  38.98 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  38.18 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  39.59 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0527  putative sensor with HAMP domain protein  38.1 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3665  putative sensor with HAMP domain  39.22 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  35.64 
 
 		 800 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0276  putative sensor with HAMP domain  39.93 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.529907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0276  putative sensor with HAMP domain protein  39.93 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 858 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  30.48 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 862 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 872 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 803 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  27.75 
 
 		 801 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 946 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1361  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 		 912 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  27.43 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0935  putative sensor with HAMP domain  26.55 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0423027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 810 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  26.32 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  28.8 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0878  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 840 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00403234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 827 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 		 546 aa  69.7  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0300  putative sensor with HAMP domain  26.1 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.168861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  25.11 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  24.43 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 812 aa  65.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  25.39 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  25.26 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  24.47 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  24.37 
 
 		 835 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 		 1064 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  22.64 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05078  hypothetical protein  30.65 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  21.69 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  22.87 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.37 
 
 		 573 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  21.17 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  34.82 
 
 		 658 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.57 
 
 		 823 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  23.67 
 
 		 405 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  34.82 
 
 		 658 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  34.82 
 
 		 658 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  34.82 
 
 		 658 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  34.82 
 
 		 658 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.77 
 
 		 561 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  31.82 
 
 		 658 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  33.04 
 
 		 658 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 578 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 		 661 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  30.77 
 
 		 882 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 578 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00718884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  22.22 
 
 		 560 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.04 
 
 		 720 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 525 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2381  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 578 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 		 623 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.65 
 
 		 512 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  35.8 
 
 		 518 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  22.54 
 
 		 562 aa  49.3  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.63 
 
 		 660 aa  49.3  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 518 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  41.82 
 
 		 658 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  43.24 
 
 		 497 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  34.23 
 
 		 660 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  24.52 
 
 		 576 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  34.23 
 
 		 660 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  34.23 
 
 		 660 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  38.81 
 
 		 660 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  34.23 
 
 		 660 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  34.23 
 
 		 660 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  30.51 
 
 		 650 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 626 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  30.51 
 
 		 650 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 636 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  30.51 
 
 		 660 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 		 658 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.56 
 
 		 657 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  29.31 
 
 		 660 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  36.56 
 
 		 599 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.49 
 
 		 1177 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  27.97 
 
 		 660 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  33.61 
 
 		 705 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  25.54 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 		 660 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 660 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 		 660 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 		 660 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 		 660 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  27.97 
 
 		 650 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 		 660 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  33.33 
 
 		 730 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 880 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  29.73 
 
 		 472 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>