More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4254 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 407 aa  836    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  61.19 
 
 		 408 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  52.49 
 
 		 405 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  58.71 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  56.99 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  49.24 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  26.96 
 
 		 800 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  27.5 
 
 		 560 aa  96.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.46 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  26.71 
 
 		 562 aa  94  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  25.93 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  23.49 
 
 		 572 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 604 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  23.29 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4236  sensor protein  27.78 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4067  sensor protein  26.52 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000038366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0527  putative sensor with HAMP domain protein  23.84 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  23.51 
 
 		 561 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  22.26 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 546 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  23.13 
 
 		 582 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0105  hypothetical protein  23.68 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0276  putative sensor with HAMP domain  23.02 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.529907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0276  putative sensor with HAMP domain protein  23.02 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  24.91 
 
 		 715 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  26.61 
 
 		 835 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 		 827 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3665  putative sensor with HAMP domain  25.09 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.98 
 
 		 856 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.61 
 
 		 573 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  22.74 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  29.2 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.14 
 
 		 1064 aa  70.1  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 678 aa  69.7  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  22.95 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  26.32 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  26.88 
 
 		 185 aa  67  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  21.35 
 
 		 556 aa  66.2  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  34.23 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2921  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 589 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  26.77 
 
 		 655 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  34.96 
 
 		 186 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.86 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.57 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1022 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 		 862 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4438  hypothetical protein  30.57 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.4 
 
 		 656 aa  63.9  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.574957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  27.92 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  27.55 
 
 		 982 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 611 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  31.19 
 
 		 187 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  28.79 
 
 		 195 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.22 
 
 		 1078 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.14 
 
 		 858 aa  62.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  33.03 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0603  hypothetical protein  33.01 
 
 		 194 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  28.4 
 
 		 733 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  32.11 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  32.84 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1550  putative PAS/PAC sensor protein  23.88 
 
 		 556 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.81 
 
 		 995 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 		 1003 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.29 
 
 		 853 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  25.48 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.57 
 
 		 1184 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.43 
 
 		 901 aa  60.5  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 839 aa  60.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 767 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01960  cytochrome c family protein  33.93 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0720592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  26.54 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  26.97 
 
 		 576 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  26.54 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  26.54 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 		 1271 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  26.54 
 
 		 613 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2123  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 688 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.267371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  26.54 
 
 		 613 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  26.61 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  31.65 
 
 		 799 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  30.58 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 799 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 799 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.5 
 
 		 754 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  23.22 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 632 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 1131 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 733 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3116  histidine kinase  20.06 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1021  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.55 
 
 		 1051 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 619 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  30.91 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  25.48 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05451  two-component sensor histidine kinase  29.35 
 
 		 685 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 612 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0300  putative sensor with HAMP domain  27.23 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.168861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>