230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0085 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  100 
 
 		 300 aa  611  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  59.33 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  59.67 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0527  putative sensor with HAMP domain protein  55.7 
 
 		 313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0276  putative sensor with HAMP domain protein  53.85 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0276  putative sensor with HAMP domain  53.85 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.529907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3665  putative sensor with HAMP domain  53 
 
 		 301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  40.53 
 
 		 800 aa  258  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 		 858 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  36.93 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4236  sensor protein  39.59 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4067  sensor protein  40.96 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000038366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0105  hypothetical protein  38.28 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3116  histidine kinase  33.12 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 803 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  23.4 
 
 		 801 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 872 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  24.91 
 
 		 835 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  28.99 
 
 		 410 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 827 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0935  putative sensor with HAMP domain  22.99 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0423027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  24.83 
 
 		 408 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.25 
 
 		 862 aa  85.9  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0300  putative sensor with HAMP domain  29.82 
 
 		 405 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.168861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  23.34 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  24.04 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  22.95 
 
 		 407 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  23.69 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 812 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  24.1 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 946 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1361  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.99 
 
 		 912 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0878  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 840 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00403234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  22.04 
 
 		 561 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  23.41 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  24.14 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05078  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.32 
 
 		 573 aa  65.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.78 
 
 		 700 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.78 
 
 		 700 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  26.49 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  27.96 
 
 		 582 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.03 
 
 		 1064 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  25 
 
 		 882 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.62 
 
 		 810 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  20.33 
 
 		 534 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2469  histidine kinase, HAMP region  38.96 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.521658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  35.8 
 
 		 730 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  24.22 
 
 		 572 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 		 651 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  35.71 
 
 		 535 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.42 
 
 		 597 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.85 
 
 		 661 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.77 
 
 		 564 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  22.11 
 
 		 560 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.18 
 
 		 651 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.49 
 
 		 651 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1610  putative signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 485 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149131 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 845 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3201  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 		 608 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.608915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 667 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.9 
 
 		 823 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1963  chemotaxis sensory transducer  38.81 
 
 		 535 aa  49.3  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 655 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 		 626 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  19.9 
 
 		 471 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 		 636 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  44.64 
 
 		 1200 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 880 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 731 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  31.34 
 
 		 465 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1467  sensor protein  37.93 
 
 		 537 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.186539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 1119 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 662 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 518 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  32 
 
 		 518 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.07 
 
 		 512 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.21 
 
 		 832 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1128 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  27.43 
 
 		 705 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 733 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  30.84 
 
 		 1111 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.38 
 
 		 538 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 733 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  24.88 
 
 		 551 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  21.46 
 
 		 481 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 807 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  25 
 
 		 548 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  23.58 
 
 		 461 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  23.58 
 
 		 461 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  23.58 
 
 		 461 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 676 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0906179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  26.76 
 
 		 1142 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  26.76 
 
 		 1142 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2100  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 512 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0381834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 		 565 aa  46.2  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.327894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  30.43 
 
 		 661 aa  45.8  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>