More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4551 on replicon NC_013160
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 302 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  98.68 
 
 		 302 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  60.07 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0276  putative sensor with HAMP domain protein  58 
 
 		 301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0276  putative sensor with HAMP domain  58 
 
 		 301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.529907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0527  putative sensor with HAMP domain protein  51.99 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3665  putative sensor with HAMP domain  56.07 
 
 		 301 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  44.37 
 
 		 800 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  39.22 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.08 
 
 		 858 aa  245  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4067  sensor protein  41.64 
 
 		 290 aa  225  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000038366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0105  hypothetical protein  37.84 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4236  sensor protein  38.98 
 
 		 291 aa  215  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3116  histidine kinase  35.56 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 872 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  24.36 
 
 		 801 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 803 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 946 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0935  putative sensor with HAMP domain  28.47 
 
 		 410 aa  92.8  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0423027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  27.38 
 
 		 410 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0300  putative sensor with HAMP domain  28.89 
 
 		 405 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.168861  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1361  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 912 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.34 
 
 		 812 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  25.74 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 		 862 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  26.06 
 
 		 561 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  27.16 
 
 		 835 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.15 
 
 		 827 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 556 aa  80.5  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0878  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 840 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00403234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  22.26 
 
 		 407 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  22.03 
 
 		 405 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  23.96 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.15 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  24.42 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  26.96 
 
 		 572 aa  72.8  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  22.75 
 
 		 475 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  23.61 
 
 		 582 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  24.89 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 810 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  22.97 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  23.61 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.41 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  25.48 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  27.11 
 
 		 882 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.59 
 
 		 661 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.9 
 
 		 1064 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 636 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 626 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 546 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05078  hypothetical protein  28.8 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 		 651 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0878  histidine kinase, HAMP protein  35.35 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.02 
 
 		 823 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2477  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200364  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  20.42 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 		 621 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.650368  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 		 651 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1467  sensor protein  38.98 
 
 		 537 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.186539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.08 
 
 		 597 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 639 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  28.85 
 
 		 1142 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  28.85 
 
 		 1142 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  36.36 
 
 		 730 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 639 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 1356 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 421 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.07 
 
 		 1212 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 639 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  29.63 
 
 		 660 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  31.48 
 
 		 658 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.07 
 
 		 628 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 		 968 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  29.63 
 
 		 660 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 574 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 733 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34 
 
 		 660 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 		 658 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.68 
 
 		 650 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 		 608 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  29.63 
 
 		 660 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  34 
 
 		 463 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  29.63 
 
 		 660 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 		 516 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  29.63 
 
 		 660 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  29.03 
 
 		 658 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 511 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.1 
 
 		 708 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  29.03 
 
 		 658 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  29.03 
 
 		 658 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  29.03 
 
 		 658 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  29.63 
 
 		 660 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  20 
 
 		 481 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  29.03 
 
 		 658 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 679 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 493 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2307  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 666 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 641 aa  51.2  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 569 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>