More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3665 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3665  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 301 aa  613  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0276  putative sensor with HAMP domain protein  69.77 
 
 		 301 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0276  putative sensor with HAMP domain  69.77 
 
 		 301 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.529907 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  55.74 
 
 		 302 aa  338  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0527  putative sensor with HAMP domain protein  53.38 
 
 		 313 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  55.07 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  53 
 
 		 300 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  39.32 
 
 		 800 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 858 aa  235  8e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  37.5 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4067  sensor protein  40 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000038366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0105  hypothetical protein  39.19 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4236  sensor protein  39.19 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3116  histidine kinase  33.64 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 872 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0300  putative sensor with HAMP domain  29.41 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.168861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  24.15 
 
 		 801 aa  92.8  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  29.95 
 
 		 410 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0935  putative sensor with HAMP domain  24.41 
 
 		 410 aa  89.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0423027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 827 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 862 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  25.17 
 
 		 407 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 946 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  25.88 
 
 		 835 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0878  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 		 840 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00403234  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 556 aa  79.3  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 		 812 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 810 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1361  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 912 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 		 803 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05078  hypothetical protein  27.6 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  23.1 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  22.48 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  22.77 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  22.83 
 
 		 475 aa  67  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  24.83 
 
 		 400 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  24.9 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  24.1 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  33.64 
 
 		 658 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  30.37 
 
 		 882 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  34.58 
 
 		 658 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  22.34 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.18 
 
 		 573 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.71 
 
 		 660 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33 
 
 		 660 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 660 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  34.02 
 
 		 658 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  34.02 
 
 		 658 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  34.02 
 
 		 658 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  34.02 
 
 		 658 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  34.02 
 
 		 658 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.7 
 
 		 661 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  22.11 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.11 
 
 		 1064 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  22.78 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  24.88 
 
 		 562 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  25.97 
 
 		 650 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  27.45 
 
 		 660 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  30.36 
 
 		 1127 aa  55.8  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1128 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  27.45 
 
 		 650 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  33.94 
 
 		 660 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  27.45 
 
 		 650 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  28.1 
 
 		 660 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  30.19 
 
 		 660 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  34.86 
 
 		 660 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.55 
 
 		 676 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  33.94 
 
 		 660 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.03 
 
 		 650 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  36.61 
 
 		 660 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  36.61 
 
 		 660 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 628 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.608397  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.66 
 
 		 561 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  36.61 
 
 		 660 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 502 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  36.56 
 
 		 660 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  33.94 
 
 		 660 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0585  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  32 
 
 		 706 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000132912  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2469  histidine kinase, HAMP region  33.33 
 
 		 269 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.521658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  46.38 
 
 		 535 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  27.45 
 
 		 660 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  33.94 
 
 		 1111 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 		 630 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1768  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 516 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.23 
 
 		 603 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 749 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  35.71 
 
 		 660 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.82 
 
 		 1177 aa  52.8  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 572 aa  52.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  23.89 
 
 		 422 aa  52.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.67 
 
 		 603 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.41 
 
 		 660 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 677 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.134066  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 		 705 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 660 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 547 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 		 554 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.2 
 
 		 597 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 733 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>