More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0303 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0303  sensory box protein  100 
 
 		 405 aa  832    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0023  putative PAS/PAC sensor protein  65.1 
 
 		 408 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.291981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  52.49 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0753  putative PAS/PAC sensor protein  51.65 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000171105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3959  putative PAS/PAC sensor protein  53.93 
 
 		 399 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00121545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4044  putative PAS/PAC sensor protein  53.39 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.571618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  26.52 
 
 		 560 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  23.64 
 
 		 561 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  25.89 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  23.57 
 
 		 582 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  28.01 
 
 		 572 aa  90.9  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  25.37 
 
 		 800 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0527  putative sensor with HAMP domain protein  25.57 
 
 		 313 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.46 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  30.21 
 
 		 835 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 546 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  22.38 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1154  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.85 
 
 		 856 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0264  hypothetical protein  34.4 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  22.89 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  22.03 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  23.37 
 
 		 556 aa  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0276  putative sensor with HAMP domain  22.09 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.529907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0276  putative sensor with HAMP domain protein  22.09 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  22.67 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.1 
 
 		 1064 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.59 
 
 		 862 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  25 
 
 		 562 aa  74.3  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  20.6 
 
 		 801 aa  73.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  25.28 
 
 		 715 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4067  sensor protein  25.63 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000038366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3910  hypothetical protein  30.05 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 604 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3429  hypothetical protein  32.74 
 
 		 195 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4079  cytochrome c family protein  36.89 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3665  putative sensor with HAMP domain  23.48 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3428  cytochrome c family protein, putative  30.86 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.94 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.3 
 
 		 655 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 827 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.82 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0918  cytochrome c family protein  28.26 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0137  hypothetical protein  28.38 
 
 		 197 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0663303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0105  hypothetical protein  21.92 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 608 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  23.93 
 
 		 608 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 		 754 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 736 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2921  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 589 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.54 
 
 		 805 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  20.28 
 
 		 564 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  25.5 
 
 		 610 aa  62  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 		 812 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  26.21 
 
 		 729 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.35 
 
 		 656 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.574957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  22.5 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 		 611 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.01 
 
 		 603 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1022 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.87 
 
 		 541 aa  60.1  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.35 
 
 		 853 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1881  hypothetical protein  24.57 
 
 		 193 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  21.37 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  21.08 
 
 		 858 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  27.38 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  27.38 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  27.38 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  27.38 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  27.38 
 
 		 613 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  24.24 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  27.38 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  27.38 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1021  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.36 
 
 		 1051 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.51 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.16 
 
 		 1058 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1892  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.34 
 
 		 771 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1184 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1290  hypothetical protein  27.27 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0723  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.61 
 
 		 1238 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.905647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.23 
 
 		 603 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1430  hypothetical protein  30.08 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  24.32 
 
 		 982 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  25.15 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 897 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  32.46 
 
 		 762 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1184 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1977  hypothetical protein  31.19 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 658 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.826724 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  29.41 
 
 		 545 aa  57  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1470  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 716 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246834 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 571 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.13 
 
 		 608 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 872 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 1078 aa  56.6  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0300  putative sensor with HAMP domain  23.53 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.168861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 619 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.5 
 
 		 561 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182871  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 733 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>