54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1912 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1912  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 201 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.436176  unclonable  0.00000739148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0360  putative PAS/PAC sensor protein  35.14 
 
 		 454 aa  75.5  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0300  putative sensor with HAMP domain  50.88 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  57.14 
 
 		 410 aa  72  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  62.5 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1634  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  52.08 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2111  diguanylate cyclase  57.5 
 
 		 392 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0935  putative sensor with HAMP domain  46.15 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0423027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0846  response regulator receiver protein  51.06 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1554  GGDEF domain-containing protein  50 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3335  histidine kinase  30.66 
 
 		 404 aa  65.5  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248975  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2652  histidine kinase  29.63 
 
 		 718 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.029799  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2773  hypothetical protein  33.65 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  50 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  50 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1054  hypothetical protein  30.33 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.452914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1890  histidine kinase  30 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00251613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  46.3 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  48.98 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0880  histidine kinase  32.33 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216006 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3366  histidine kinase  32.33 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1412  histidine kinase  27.64 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1521  hypothetical protein  26.67 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  36.67 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2970  histidine kinase  24.81 
 
 		 386 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1339  PAS sensor protein  48.15 
 
 		 328 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 897 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2728  histidine kinase  26.32 
 
 		 387 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  36.67 
 
 		 253 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  36.67 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  35 
 
 		 249 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  35 
 
 		 249 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0445  hypothetical protein  28.99 
 
 		 166 aa  52  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.497847  normal  0.426616 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0902  histidine kinase  29.9 
 
 		 399 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000164355  hitchhiker  0.00000000561176 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0278  histidine kinase  25.18 
 
 		 406 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.284649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0616  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.05 
 
 		 766 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0116444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2301  histidine kinase  26.19 
 
 		 386 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229596 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  28.33 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3006  histidine kinase  26.19 
 
 		 394 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1696  histidine kinase  25 
 
 		 380 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0566842  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 377 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0931  hypothetical protein  25.93 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0935356 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1584  hypothetical protein  30.59 
 
 		 176 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.523318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2375  hypothetical protein  30.59 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1375  histidine kinase  25.77 
 
 		 447 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  26.92 
 
 		 1089 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000851175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1489  hypothetical protein  30.59 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.38 
 
 		 1088 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000517956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2457  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  29.73 
 
 		 1046 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.925436  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>