29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2773 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2773  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0360  putative PAS/PAC sensor protein  51.19 
 
 		 454 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0935  putative sensor with HAMP domain  48.53 
 
 		 410 aa  85.9  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0423027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  53.73 
 
 		 204 aa  84.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  52.24 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1339  PAS sensor protein  48.65 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0300  putative sensor with HAMP domain  49.15 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0283  putative sensor with HAMP domain  52.73 
 
 		 410 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0846  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  45 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  28.89 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  28.89 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  27.78 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  39.34 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  37.97 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  37.97 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  28.89 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1554  GGDEF domain-containing protein  34.69 
 
 		 389 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1634  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1912  putative PAS/PAC sensor protein  33.65 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.436176  unclonable  0.00000739148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 200 aa  62  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 796 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2111  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 392 aa  61.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  34 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1267 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 		 1478 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>