More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0861 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3172  tryptophan synthase subunit beta  68.82 
 
 		 458 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000340613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0861  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 455 aa  936    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1225  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.524383  normal  0.0499617 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00500  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 470 aa  581  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0031  tryptophan synthase subunit beta  57.08 
 
 		 451 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1259  tryptophan synthase subunit beta  56.54 
 
 		 450 aa  527  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000240862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3714  tryptophan synthase subunit beta  56.47 
 
 		 454 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0699  tryptophan synthase subunit beta  54.24 
 
 		 454 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1782  tryptophan synthase subunit beta  55.8 
 
 		 454 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1294  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  54.3 
 
 		 457 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1211  tryptophan synthase subunit beta  54.34 
 
 		 454 aa  514  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000141811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1751  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 454 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0644  tryptophan synthase subunit beta  55.36 
 
 		 453 aa  511  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0171484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2159  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 452 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0662  tryptophan synthase subunit beta  54.57 
 
 		 452 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1979  tryptophan synthase subunit beta  54.12 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0558  tryptophan synthase subunit beta  54.34 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3063  tryptophan synthase subunit beta  52.46 
 
 		 452 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3503  tryptophan synthase subunit beta  56.74 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.385411  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2123  tryptophan synthase subunit beta  54.91 
 
 		 453 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0402624  hitchhiker  0.00258343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0063  tryptophan synthase subunit beta  53.67 
 
 		 452 aa  495  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.636154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2450  tryptophan synthase subunit beta  53.57 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.896091  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1286  tryptophan synthase subunit beta  52 
 
 		 470 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1958  tryptophan synthase subunit beta  53.79 
 
 		 451 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2085  tryptophan synthase subunit beta  53.57 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000026544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1328  tryptophan synthase subunit beta  52.01 
 
 		 456 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3218  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  56.92 
 
 		 442 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1671  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  54.93 
 
 		 453 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2258  tryptophan synthase subunit beta  53.35 
 
 		 451 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2493  tryptophan synthase subunit beta  53.23 
 
 		 451 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3748  tryptophan synthase subunit beta  52.12 
 
 		 451 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1100  tryptophan synthase subunit beta  55.12 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.234808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1459  tryptophan synthase subunit beta  52.68 
 
 		 452 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1277  tryptophan synthase subunit beta  52.23 
 
 		 450 aa  488  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000000682618  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0070  tryptophan synthase subunit beta  52.89 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.531769  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3805  tryptophan synthase subunit beta  51.45 
 
 		 451 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1735  tryptophan synthase subunit beta  52.9 
 
 		 450 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3865  tryptophan synthase subunit beta  52.9 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0495522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0327  tryptophan synthase subunit beta  52.12 
 
 		 451 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1205  tryptophan synthase subunit beta  53.74 
 
 		 451 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2379  tryptophan synthase subunit beta  52.34 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0816  tryptophan synthase subunit beta  55.35 
 
 		 441 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3889  tryptophan synthase subunit beta  51.67 
 
 		 451 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1293  tryptophan synthase subunit beta  51.56 
 
 		 451 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1594  tryptophan synthase subunit beta  50.67 
 
 		 453 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0305  tryptophan synthase subunit beta  50.45 
 
 		 450 aa  480  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1213  tryptophan synthase subunit beta  52.33 
 
 		 451 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0356  tryptophan synthase subunit beta  52.54 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3654  tryptophan synthase subunit beta  50.99 
 
 		 454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.142399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2404  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 453 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2074  tryptophan synthase subunit beta  52.53 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3675  tryptophan synthase subunit beta  55.8 
 
 		 404 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0890  tryptophan synthase subunit beta  51.9 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1642  tryptophan synthase subunit beta  48.55 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1773  tryptophan synthase subunit beta  51.34 
 
 		 450 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0331  tryptophan synthase subunit beta  52.77 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.869557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0593  tryptophan synthase subunit beta  53.12 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0382  tryptophan synthase subunit beta  55 
 
 		 422 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.468203  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0398  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 422 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0473085  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1035  tryptophan synthase subunit beta  51.22 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00331914  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0917  tryptophan synthase subunit beta  51.11 
 
 		 454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243101  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_905  pyridoxal-phosphate dependent tryptophan synthase-like protein  50.89 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205242  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0451  tryptophan synthase subunit beta  51.35 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0346  tryptophan synthase subunit beta  50.45 
 
 		 452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.344274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1707  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  51.63 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3711  tryptophan synthase subunit beta  48.68 
 
 		 454 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1254  tryptophan synthase subunit beta  53.9 
 
 		 417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181406  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0725  tryptophan synthase subunit beta  53.57 
 
 		 418 aa  443  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000155508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0335  tryptophan synthase subunit beta  50.9 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1929  tryptophan synthase subunit beta  51.99 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2615  tryptophan synthase subunit beta  49.55 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0256  tryptophan synthase subunit beta  51.01 
 
 		 457 aa  435  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1028  tryptophan synthase subunit beta  47.96 
 
 		 453 aa  425  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.992034  normal  0.0454913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3949  tryptophan synthase subunit beta  51.57 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.334602  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1633  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  53.25 
 
 		 436 aa  425  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.213462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4783  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  50.48 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2923  tryptophan synthase subunit beta  50.24 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869971  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3175  tryptophan synthase subunit beta  50.83 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752664  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2591  tryptophan synthase subunit beta  49.76 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2020  tryptophan synthase subunit beta  47.84 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000317407 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2635  tryptophan synthase subunit beta  49.76 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.429999  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2628  tryptophan synthase subunit beta  49.53 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1139  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  49.56 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.802779  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1870  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  47.12 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1691  tryptophan synthase subunit beta  45.56 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.248453 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1046  tryptophan synthase subunit beta  46.9 
 
 		 416 aa  361  2e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.931659  hitchhiker  0.0000000138833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2532  tryptophan synthase subunit beta  46.21 
 
 		 435 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2529  tryptophan synthase subunit beta  44.18 
 
 		 434 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2113  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  43.84 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0990  tryptophan synthase subunit beta  44.24 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1206  tryptophan synthase subunit beta  44.71 
 
 		 413 aa  339  8e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1916  tryptophan synthase subunit beta  44.21 
 
 		 420 aa  335  7e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.315987  normal  0.860019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1176  tryptophan synthase subunit beta  44.21 
 
 		 418 aa  333  3e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.541584  normal  0.191375 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1418  tryptophan synthase subunit beta  43.78 
 
 		 409 aa  330  3e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.955959  normal  0.212378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2012  tryptophan synthase subunit beta  42.24 
 
 		 440 aa  315  9e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.909029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3061  tryptophan synthase subunit beta  38.24 
 
 		 447 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135575  hitchhiker  0.00104829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0678  tryptophan synthase subunit beta  38.12 
 
 		 446 aa  266  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0544758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1274  tryptophan synthase subunit beta  34.96 
 
 		 393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.545932  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0353  tryptophan synthase subunit beta  33.75 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2939  tryptophan synthase subunit beta  32.82 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>