More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2939 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2939  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 387 aa  793    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1440  tryptophan synthase subunit beta  92.49 
 
 		 386 aa  741    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 		 398 aa  538  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  68.91 
 
 		 391 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  64.42 
 
 		 391 aa  504  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  62.79 
 
 		 414 aa  497  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1349  tryptophan synthase, beta subunit  61.07 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  60.15 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  62.77 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 401 aa  477  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  60.73 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.43 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  59.33 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  59.28 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 402 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  58.03 
 
 		 411 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 413 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 408 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  58.66 
 
 		 404 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 404 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 413 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 405 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  58.82 
 
 		 410 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  57.73 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  59.08 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 411 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  59.39 
 
 		 406 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  57.87 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 395 aa  464  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  58.93 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  57.44 
 
 		 409 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  58.9 
 
 		 449 aa  457  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 409 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  57.44 
 
 		 409 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  56.27 
 
 		 403 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  58.51 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  56.03 
 
 		 414 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 419 aa  458  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  58.38 
 
 		 394 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  57.54 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  59.28 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 405 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  58.51 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0055  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.660106  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  57.74 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  55.78 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 405 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  454  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 413 aa  455  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>