More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0798 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 400 aa  826    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  72.38 
 
 		 402 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  71.98 
 
 		 440 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  70.08 
 
 		 414 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  73.02 
 
 		 382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  67.69 
 
 		 403 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 391 aa  518  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  63.4 
 
 		 396 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 401 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 398 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  61.11 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 399 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 399 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 391 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  60.88 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  62.73 
 
 		 395 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 399 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  59.32 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 399 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  58.63 
 
 		 404 aa  482  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  58.49 
 
 		 402 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1440  tryptophan synthase subunit beta  58.38 
 
 		 386 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  58.79 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  59.32 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  58.01 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  57.74 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  59.32 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  57.44 
 
 		 424 aa  474  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  58.79 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2939  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 387 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  58.79 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0644  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  58.38 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  58.22 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  58.49 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  58.38 
 
 		 400 aa  472  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0728  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 405 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.27 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  57.03 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0720  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 391 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0709059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  55.44 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  58.12 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 		 406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  59.64 
 
 		 402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 447 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 		 407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  58.42 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  55.81 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  58.2 
 
 		 406 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  55.7 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  57.96 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  59.21 
 
 		 407 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  58.36 
 
 		 393 aa  468  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 406 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  56.3 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  58.22 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  464  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  56.7 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  56.66 
 
 		 394 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 411 aa  464  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  56.3 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  56.35 
 
 		 406 aa  464  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  56.7 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  56.69 
 
 		 411 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  55.15 
 
 		 410 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  57.74 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>