More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0720 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0720  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 391 aa  802    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0709059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 		 391 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  61.68 
 
 		 440 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 403 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 		 398 aa  481  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 397 aa  481  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 394 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  58.01 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 405 aa  477  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  60.11 
 
 		 382 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 397 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 397 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 397 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  58.27 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  60.89 
 
 		 391 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  58.01 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  58.79 
 
 		 409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  56.33 
 
 		 407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  56.89 
 
 		 413 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 399 aa  464  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 395 aa  467  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  57.48 
 
 		 414 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  56.89 
 
 		 413 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 403 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  59.02 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  57.22 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  56.66 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  56.33 
 
 		 418 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  55.04 
 
 		 411 aa  461  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  57.66 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  55.81 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  56.3 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  56.3 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 406 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  55.7 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 409 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  57.54 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  58.51 
 
 		 396 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0942  tryptophan synthase subunit beta  56.48 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  55.81 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1440  tryptophan synthase subunit beta  58.79 
 
 		 386 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  56.48 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  55.81 
 
 		 399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 		 428 aa  451  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  57.89 
 
 		 399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  55.04 
 
 		 411 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 373 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  55.81 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>