More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001499 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  100 
 
 		 407 aa  834    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  66.33 
 
 		 400 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  71.57 
 
 		 406 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  65.08 
 
 		 403 aa  541  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  66 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  67.01 
 
 		 403 aa  535  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 400 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  61.27 
 
 		 400 aa  525  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  64.84 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 407 aa  521  1e-147  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  65.56 
 
 		 393 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  61.11 
 
 		 399 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 408 aa  491  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  62.22 
 
 		 412 aa  488  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 401 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  59.21 
 
 		 400 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  57.73 
 
 		 403 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  58.7 
 
 		 440 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 414 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  56.12 
 
 		 405 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  56.48 
 
 		 409 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52286  tryptophan synthase, beta chain  59.43 
 
 		 385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 418 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  54.2 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  56.64 
 
 		 382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  54.34 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  53.88 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  54.57 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  53.94 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  53.35 
 
 		 407 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  55.3 
 
 		 409 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  55.01 
 
 		 401 aa  441  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  55.24 
 
 		 420 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  55.75 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  53.44 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  53.44 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  53.18 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  53.44 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  53.15 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  53.63 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  53.44 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  54.12 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  53.18 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  53.44 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  53.44 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  53.69 
 
 		 397 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  53.05 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 		 404 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0101  tryptophan synthase, beta subunit  54.38 
 
 		 398 aa  434  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  55.18 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  55.18 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  53.69 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  53.57 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  52.99 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  55.18 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  54.12 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  55.18 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  53.18 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  56.04 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  53.25 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  56.7 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  53.23 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  53.18 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  52.53 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  53.18 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  54.2 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  55.18 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  53.23 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  53.18 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  53.44 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  55.18 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  53.75 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3191  tryptophan synthase, beta subunit  53.81 
 
 		 405 aa  433  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  53.16 
 
 		 402 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1686  tryptophan synthase subunit beta  55.9 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.815496  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  53.02 
 
 		 404 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3305  tryptophan synthase, beta subunit  55.21 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.980643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  52.85 
 
 		 404 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  52.27 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  52.02 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  52.39 
 
 		 410 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  52.88 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  54.17 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  51.36 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 424 aa  430  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>