More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52286 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_52286  tryptophan synthase, beta chain  100 
 
 		 385 aa  790    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  65.31 
 
 		 400 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 400 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 400 aa  475  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  57.91 
 
 		 408 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  55.13 
 
 		 403 aa  431  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  59.43 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  55.18 
 
 		 403 aa  425  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  54.1 
 
 		 400 aa  421  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  53.62 
 
 		 420 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  52.87 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  55.85 
 
 		 399 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  51.62 
 
 		 420 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  51.37 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  51.37 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  52.44 
 
 		 401 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  51.17 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  52.44 
 
 		 401 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  54.4 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  49.88 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  52.21 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  51.17 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  49.1 
 
 		 402 aa  398  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  50.13 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  50.91 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  51.18 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  51.17 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  49.74 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  51.95 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  49.74 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  50.25 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  49.74 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 401 aa  388  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  50.92 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  49.74 
 
 		 409 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  49.62 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  49.87 
 
 		 405 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  49.1 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  50.38 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  49.24 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  51.96 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  51.85 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  51.04 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  48.59 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  48.59 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  48.59 
 
 		 397 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  48.59 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  49.61 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  47.56 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  48.59 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  48.59 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  49.1 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  48.85 
 
 		 397 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  48.85 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  49.1 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  48.85 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  48.85 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  50.91 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  49.1 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  48.85 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  48.59 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  51.18 
 
 		 414 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  49.61 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  48.85 
 
 		 397 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  48.21 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  48.48 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1686  tryptophan synthase subunit beta  51.72 
 
 		 454 aa  378  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.815496  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  48.21 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  48.59 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  48.08 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1440  tryptophan synthase subunit beta  48.84 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  48.21 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  50.13 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  48.06 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  47.83 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  48.85 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3075  tryptophan synthase subunit beta  49.87 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000212067  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  48.45 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  48.45 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2939  tryptophan synthase subunit beta  49.23 
 
 		 387 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  46.84 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  48.97 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  48.35 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  48.21 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  48.06 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  48.45 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  48.45 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  48.21 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  47.73 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  48.59 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  49.1 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  49.09 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  49.1 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  46.85 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>