More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1989 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 400 aa  827    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  85.96 
 
 		 399 aa  691    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  73.75 
 
 		 401 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  72.68 
 
 		 401 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  72.68 
 
 		 401 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  69.21 
 
 		 403 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  66.25 
 
 		 400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  66.08 
 
 		 407 aa  561  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  67.68 
 
 		 403 aa  558  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  61.27 
 
 		 407 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  60.8 
 
 		 400 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 406 aa  481  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 408 aa  477  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  54.4 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  54.74 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  53.93 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  53.81 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  52.58 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  52.58 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  52.81 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52286  tryptophan synthase, beta chain  54.1 
 
 		 385 aa  421  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  52.39 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  52.42 
 
 		 420 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  53.63 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0101  tryptophan synthase, beta subunit  53.47 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  54.26 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  51.92 
 
 		 420 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  51.91 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  52.67 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  50.9 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  51.15 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  50.9 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  51.02 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  53.65 
 
 		 409 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  54.08 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  51.66 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1440  tryptophan synthase subunit beta  53.39 
 
 		 386 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281264  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  51.66 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  53 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  51.28 
 
 		 394 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  51.39 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  51.7 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  54.16 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  51.15 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  50.38 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  51.91 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  51.39 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  52.28 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  51.26 
 
 		 406 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  52.16 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  50.78 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  51.27 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  51.01 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  51.14 
 
 		 397 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  51.28 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  51.14 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  51.42 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  51.39 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  50.78 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  50.39 
 
 		 455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  53.64 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  51.04 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  51.04 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  51.04 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  50.78 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  49.62 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1741  tryptophan synthase subunit beta  52.6 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  52.34 
 
 		 391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  52.15 
 
 		 396 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  51.26 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  50.25 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  50 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  51.03 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  51.55 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  50.38 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  52.9 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2965  tryptophan synthase subunit beta  50.25 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0872098  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  50.63 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  52.2 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  51.16 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  51.4 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4868  tryptophan synthase subunit beta  51.01 
 
 		 421 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0695  tryptophan synthase subunit beta  52.03 
 
 		 401 aa  401  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>