More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1741 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1741  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 394 aa  806    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2467  tryptophan synthase subunit beta  83.25 
 
 		 395 aa  653    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1588  tryptophan synthase subunit beta  77.26 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00363039  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1535  tryptophan synthase subunit beta  75.13 
 
 		 390 aa  607  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.442793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3479  tryptophan synthase subunit beta  75.45 
 
 		 387 aa  594  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0124  tryptophan synthase subunit beta  65.21 
 
 		 401 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 394 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  63.25 
 
 		 405 aa  478  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.73 
 
 		 409 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 394 aa  474  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2003  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 396 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  61.79 
 
 		 402 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2207  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.823385  normal  0.0123051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2302  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2255  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0836198 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2671  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1458  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1516  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2805  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 396 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3023  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1936  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2176  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1682  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.93556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1660  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1524  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 396 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0500753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1425  tryptophan synthase subunit beta  59.27 
 
 		 403 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2407  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2916  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 407 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1790  tryptophan synthase subunit beta  60.73 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1150  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 396 aa  461  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2454  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2705  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  61.68 
 
 		 404 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2833  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1586  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 409 aa  461  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02292  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 393 aa  461  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2133  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.31152  normal  0.733883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01235  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1853  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0734118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1858  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  57.92 
 
 		 426 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 		 399 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  56.52 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 		 399 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1602  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0886138 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  56.01 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01245  hypothetical protein  58.21 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1916  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000988826 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 401 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003084  tryptophan synthase beta chain  59.54 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1420  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  57.85 
 
 		 418 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2387  tryptophan synthase, beta subunit  57.95 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.532965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2366  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1871  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000282354 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1370  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1460  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00292681  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  58.81 
 
 		 392 aa  457  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0792  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00347207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02762  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1893  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.964383  hitchhiker  0.00187983 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2316  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  58.01 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  58.01 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  57.89 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2046  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1936  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  59.33 
 
 		 394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  57.76 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  59.37 
 
 		 388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  58.68 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1486  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  57.65 
 
 		 404 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  56.78 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.43 
 
 		 406 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1872  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0911585 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2321  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  58.64 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 411 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  59.21 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  57.92 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>